Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ribc2Q9D4Q1 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ribc2Q9D4Q1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ribc2Q9D4Q1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ribc2Q9D4Q1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ribc2Q9D4Q1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ribc2Q9D4Q1 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.8 ms