Protein–RNA interactions for Protein: Q91Y15

Pcdha5, Protocadherin alpha 5, mousemouse

Predictions only

Length 934 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcdha5Q91Y15 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Pcdha5Q91Y15 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pcdha5Q91Y15 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pcdha5Q91Y15 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pcdha5Q91Y15 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pcdha5Q91Y15 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms