Protein–RNA interactions for Protein: Q80ZU5

Ccdc181, Coiled-coil domain-containing protein 181, mousemouse

Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc181Q80ZU5 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ccdc181Q80ZU5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ccdc181Q80ZU5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ccdc181Q80ZU5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ccdc181Q80ZU5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ccdc181Q80ZU5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms