Protein–RNA interactions for Protein: Q6PHP6

Lrrn2, Leucine rich repeat protein 2, neuronal, isoform CRA_b, mousemouse

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Length 730 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrn2Q6PHP6 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Lrrn2Q6PHP6 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Lrrn2Q6PHP6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Lrrn2Q6PHP6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Lrrn2Q6PHP6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Lrrn2Q6PHP6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms