Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retreg2Q6NS82 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retreg2Q6NS82 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Retreg2Q6NS82 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Retreg2Q6NS82 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retreg2Q6NS82 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retreg2Q6NS82 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms