Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Arhgap20Q6IFT4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Arhgap20Q6IFT4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Arhgap20Q6IFT4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Arhgap20Q6IFT4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Arhgap20Q6IFT4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms