Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU00

Dcdc2, Doublecortin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2Q5DU00 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Dcdc2Q5DU00 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Dcdc2Q5DU00 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Dcdc2Q5DU00 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Dcdc2Q5DU00 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Dcdc2Q5DU00 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.4 ms