Protein–RNA interactions for Protein: Q5DU00

Dcdc2, Doublecortin domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dcdc2Q5DU00 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC32.48■■■□□ 2.79
Dcdc2Q5DU00 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Dcdc2Q5DU00 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.65■■■□□ 2.5
Dcdc2Q5DU00 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Dcdc2Q5DU00 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC29.95■■■□□ 2.38
Dcdc2Q5DU00 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
Dcdc2Q5DU00 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Dcdc2Q5DU00 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
Dcdc2Q5DU00 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.41■■■□□ 2.3
Dcdc2Q5DU00 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Dcdc2Q5DU00 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Dcdc2Q5DU00 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Dcdc2Q5DU00 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Dcdc2Q5DU00 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Dcdc2Q5DU00 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Dcdc2Q5DU00 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Dcdc2Q5DU00 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Dcdc2Q5DU00 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Dcdc2Q5DU00 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Dcdc2Q5DU00 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Dcdc2Q5DU00 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
Dcdc2Q5DU00 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Dcdc2Q5DU00 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Dcdc2Q5DU00 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Dcdc2Q5DU00 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
Dcdc2Q5DU00 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Dcdc2Q5DU00 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Dcdc2Q5DU00 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Dcdc2Q5DU00 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Dcdc2Q5DU00 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Dcdc2Q5DU00 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Dcdc2Q5DU00 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Dcdc2Q5DU00 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Dcdc2Q5DU00 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Dcdc2Q5DU00 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Dcdc2Q5DU00 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Dcdc2Q5DU00 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Dcdc2Q5DU00 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Dcdc2Q5DU00 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Dcdc2Q5DU00 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Dcdc2Q5DU00 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Dcdc2Q5DU00 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2Q5DU00 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Dcdc2Q5DU00 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Dcdc2Q5DU00 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Dcdc2Q5DU00 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Dcdc2Q5DU00 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Dcdc2Q5DU00 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Dcdc2Q5DU00 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Dcdc2Q5DU00 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Dcdc2Q5DU00 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Dcdc2Q5DU00 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Dcdc2Q5DU00 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Dcdc2Q5DU00 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Dcdc2Q5DU00 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Dcdc2Q5DU00 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dcdc2Q5DU00 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Dcdc2Q5DU00 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Dcdc2Q5DU00 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Dcdc2Q5DU00 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Dcdc2Q5DU00 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Dcdc2Q5DU00 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dcdc2Q5DU00 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Dcdc2Q5DU00 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Dcdc2Q5DU00 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dcdc2Q5DU00 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Dcdc2Q5DU00 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Dcdc2Q5DU00 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Dcdc2Q5DU00 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Dcdc2Q5DU00 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Dcdc2Q5DU00 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Dcdc2Q5DU00 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
Dcdc2Q5DU00 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Dcdc2Q5DU00 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Dcdc2Q5DU00 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dcdc2Q5DU00 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Dcdc2Q5DU00 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Dcdc2Q5DU00 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Dcdc2Q5DU00 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Dcdc2Q5DU00 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Dcdc2Q5DU00 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Dcdc2Q5DU00 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dcdc2Q5DU00 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Dcdc2Q5DU00 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Dcdc2Q5DU00 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Dcdc2Q5DU00 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Dcdc2Q5DU00 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Dcdc2Q5DU00 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Dcdc2Q5DU00 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Dcdc2Q5DU00 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Dcdc2Q5DU00 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Dcdc2Q5DU00 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Dcdc2Q5DU00 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Dcdc2Q5DU00 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Dcdc2Q5DU00 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Dcdc2Q5DU00 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Dcdc2Q5DU00 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Dcdc2Q5DU00 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Dcdc2Q5DU00 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Dcdc2Q5DU00 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms