Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHH2

Slc22a23, Solute carrier family 22 member 23, mousemouse

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc22a23Q3UHH2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Slc22a23Q3UHH2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc22a23Q3UHH2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Slc22a23Q3UHH2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Slc22a23Q3UHH2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Slc22a23Q3UHH2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms