Protein–RNA interactions for Protein: Q12316

TY1B-GR3, Transposon Ty1-GR3 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-GR3Q12316 DCR2YLR361C 1737 nt11.68□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 AAT1YKL106W 1356 nt11.67□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 BUD31YCR063W 474 nt11.67□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 YPL136WYPL136W 369 nt11.67□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 DIP5YPL265W 1827 nt11.66□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 QRI5YLR204W 336 nt11.66□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 MRPL19YNL185C 477 nt11.66□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 SCS22YBL091C-A 528 nt11.66□□□□□ -0.54
TY1B-GR3Q12316 YLR030WYLR030W 792 nt11.64□□□□□ -0.55
TY1B-GR3Q12316 YML122CYML122C 381 nt11.64□□□□□ -0.55
TY1B-GR3Q12316 YLR162WYLR162W 357 nt11.62□□□□□ -0.55
TY1B-GR3Q12316 YDR387CYDR387C 1668 nt11.61□□□□□ -0.55
TY1B-GR3Q12316 SKP1YDR328C 585 nt11.61□□□□□ -0.55
TY1B-GR3Q12316 MDM35YKL053C-A 261 nt11.61□□□□□ -0.55
TY1B-GR3Q12316 YNL295WYNL295W 1575 nt11.61□□□□□ -0.55
TY1B-GR3Q12316 DSC3YOR223W 879 nt11.57□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 LIA1YJR070C 978 nt11.56□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 YPR130CYPR130C 408 nt11.56□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 ERV25YML012W 636 nt11.56□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 NPP2YEL016C 1482 nt11.56□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 STE3YKL178C 1413 nt11.55□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 RRP43YCR035C 1185 nt11.54□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 INP54YOL065C 1155 nt11.54□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 SSC1YJR045C 1965 nt11.52□□□□□ -0.56
TY1B-GR3Q12316 SML1YML058W 315 nt11.52□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 GPD1YDL022W 1176 nt11.51□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 GLY1YEL046C 1164 nt11.51□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 YOR200WYOR200W 399 nt11.51□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 INO1YJL153C 1602 nt11.5□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 TIF3YPR163C 1311 nt11.5□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 PPZ2YDR436W 2133 nt11.49□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 SNP1YIL061C 903 nt11.49□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 DMA2YNL116W 1569 nt11.49□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 PRY2YKR013W 990 nt11.49□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 YKL153WYKL153W 510 nt11.48□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 FIT1YDR534C 1587 nt11.46□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 FCY22YER060W-A 1593 nt11.46□□□□□ -0.57
TY1B-GR3Q12316 HAM1YJR069C 594 nt11.46□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 HRB1YNL004W 1365 nt11.46□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 HIS2YFR025C 1008 nt11.45□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 IMG1YCR046C 510 nt11.44□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 PIL1YGR086C 1020 nt11.44□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 YGR137WYGR137W 375 nt11.44□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 DML1YMR211W 1428 nt11.43□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 DST1YGL043W 930 nt11.42□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 DRE2YKR071C 1047 nt11.42□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 MTC6YHR151C 1581 nt11.42□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 UME6YDR207C 2511 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 PAB1YER165W 1734 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 CPR2YHR057C 618 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 YCL049CYCL049C 939 nt11.41□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 NFS1YCL017C 1494 nt11.4□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 YPC1YBR183W 951 nt11.4□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 MTO1YGL236C 2010 nt11.4□□□□□ -0.58
TY1B-GR3Q12316 ILV6YCL009C 930 nt11.38□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 CIA1YDR267C 993 nt11.37□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 AOS1YPR180W 1044 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 KRR1YCL059C 951 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 LCL3YGL085W 825 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 HIS3YOR202W 663 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 MNN9YPL050C 1188 nt11.36□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 FSF1YOR271C 984 nt11.35□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 WSC4YHL028W 1818 nt11.35□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 IRC7YFR055W 1023 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 ELP6YMR312W 822 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 CMP2YML057W 1815 nt11.34□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 YHR218W-AYHR218W-A 318 nt11.33□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 YBL112CYBL112C 318 nt11.33□□□□□ -0.59
TY1B-GR3Q12316 VPS65YLR322W 315 nt11.33□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 LSC1YOR142W 990 nt11.32□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YJL163CYJL163C 1668 nt11.32□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 CRH1YGR189C 1524 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YPT10YBR264C 600 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YEL075W-AYEL075W-A 612 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 RPL2AYFR031C-A 765 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 RPL2BYIL018W 765 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YKL147CYKL147C 618 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YLR463CYLR463C 552 nt11.31□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 WSC3YOL105C 1671 nt11.3□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 ABP1YCR088W 1779 nt11.3□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 NDE2YDL085W 1638 nt11.29□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 MED6YHR058C 888 nt11.29□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YIL029W-AYIL029W-A 372 nt11.29□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 MET13YGL125W 1803 nt11.29□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 FYV1YDR024W 486 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 HOC1YJR075W 1191 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 HXT10YFL011W 1641 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 TRP2YER090W 1524 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YMR252CYMR252C 405 nt11.28□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 ERR3YMR323W 1314 nt11.27□□□□□ -0.6
TY1B-GR3Q12316 YDL144CYDL144C 1071 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 AGX1YFL030W 1158 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 THI6YPL214C 1623 nt11.26□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 YOL046CYOL046C 675 nt11.25□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 OSW2YLR054C 2175 nt11.25□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 TDA4YJR116W 840 nt11.23□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 INH1YDL181W 258 nt11.22□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 GET2YER083C 858 nt11.22□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 MRN1YPL184C 1839 nt11.21□□□□□ -0.61
TY1B-GR3Q12316 CCW12YLR110C 402 nt11.2□□□□□ -0.62
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