Protein–RNA interactions for Protein: Q12098

SLX4, Structure-specific endonuclease subunit SLX4, yeastyeast

Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SLX4Q12098 YOR343CYOR343C 327 nt8.39□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 TIM50YPL063W 1431 nt8.38□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 ELP4YPL101W 1371 nt8.38□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 YTH1YPR107C 627 nt8.38□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 JHD1YER051W 1479 nt8.38□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 HRA1HRA1 564 nt8.37□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 RMA1YKL132C 1293 nt8.37□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 INO1YJL153C 1602 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 FTH1YBR207W 1398 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 PMA2YPL036W 2844 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 KDX1YKL161C 1302 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 DUS3YLR401C 2007 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 TAD2YJL035C 753 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 YMR206WYMR206W 942 nt8.36□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 YIL168WYIL168W 384 nt8.35□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 RCF1YML030W 480 nt8.35□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 HBS1YKR084C 1836 nt8.35□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 BEM1YBR200W 1656 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 SUP51tL(UAA)J 84 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt8.34□□□□□ -1.07
SLX4Q12098 MRN1YPL184C 1839 nt8.33□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 TDH1YJL052W 999 nt8.33□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 PRE10YOR362C 867 nt8.33□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 WSC4YHL028W 1818 nt8.33□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 ARO3YDR035W 1113 nt8.32□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 GLY1YEL046C 1164 nt8.32□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 PUS5YLR165C 765 nt8.32□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 YEL023CYEL023C 2049 nt8.32□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 NDE2YDL085W 1638 nt8.32□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 SGV1YPR161C 1974 nt8.31□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 ALG7YBR243C 1347 nt8.31□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 ADE1YAR015W 921 nt8.31□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 GGC1YDL198C 903 nt8.3□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 TDA4YJR116W 840 nt8.3□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 PMU1YKL128C 888 nt8.3□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 CTF3YLR381W 2202 nt8.3□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 TGL5YOR081C 2250 nt8.29□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 WSC3YOL105C 1671 nt8.29□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 FHN1YGR131W 525 nt8.28□□□□□ -1.08
SLX4Q12098 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt8.27□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 TIF3YPR163C 1311 nt8.27□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 CCR4YAL021C 2514 nt8.26□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 ORT1YOR130C 879 nt8.26□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 NUP53YMR153W 1428 nt8.26□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 YRF1-3YGR296W 5580 nt8.26□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 YRF1-6YNL339C 5580 nt8.26□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 YRF1-7YPL283C 5580 nt8.26□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 INM1YHR046C 888 nt8.25□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 TOS1YBR162C 1368 nt8.24□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 RPL12BYDR418W 498 nt8.24□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 YNL140CYNL140C 570 nt8.24□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 YOR300WYOR300W 309 nt8.24□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 YJL043WYJL043W 774 nt8.23□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 APT1YML022W 564 nt8.23□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 MRP7YNL005C 1116 nt8.23□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 ARG7YMR062C 1326 nt8.23□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 AIM34YMR003W 597 nt8.22□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 YPL277CYPL277C 1464 nt8.21□□□□□ -1.09
SLX4Q12098 PSP2YML017W 1782 nt8.21□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 SNP1YIL061C 903 nt8.21□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 KAE1YKR038C 1161 nt8.21□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 YGR137WYGR137W 375 nt8.2□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 ELP6YMR312W 822 nt8.2□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 ADE16YLR028C 1776 nt8.2□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 HAC1YFL031W 717 nt8.19□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 DST1YGL043W 930 nt8.19□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 FUS3YBL016W 1062 nt8.19□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 MAK32YCR019W 1092 nt8.18□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 STF1YDL130W-A 261 nt8.17□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 EDC2YER035W 438 nt8.17□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 snR4snR4 186 nt8.17□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 YIL108WYIL108W 2091 nt8.17□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 CPR2YHR057C 618 nt8.16□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 MTC6YHR151C 1581 nt8.16□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 TOP3YLR234W 1971 nt8.16□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 PNS1YOR161C 1620 nt8.16□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 SPR1YOR190W 1338 nt8.16□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 PFS2YNL317W 1398 nt8.15□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 KTR4YBR199W 1395 nt8.15□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 RRT6YGL146C 936 nt8.15□□□□□ -1.1
SLX4Q12098 CPT1YNL130C 1182 nt8.14□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 TPO1YLL028W 1761 nt8.14□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 YIL177CYIL177C 5277 nt8.14□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 AFG2YLR397C 2343 nt8.14□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 DIA4YHR011W 1341 nt8.13□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 CHA1YCL064C 1083 nt8.13□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 YEL009C-AYEL009C-A 408 nt8.13□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 PET494YNR045W 1470 nt8.13□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 YHC3YJL059W 1227 nt8.12□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 PMT1YDL095W 2454 nt8.11□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 NCA3YJL116C 1014 nt8.11□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 MNN9YPL050C 1188 nt8.11□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 ITR1YDR497C 1755 nt8.11□□□□□ -1.11
SLX4Q12098 STE3YKL178C 1413 nt8.11□□□□□ -1.11
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