Protein–RNA interactions for Protein: Q05016

YMR226C, NADP-dependent 3-hydroxy acid dehydrogenase, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YMR226CQ05016 GCD11YER025W 1584 nt7.35□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 MAS2YHR024C 1449 nt7.35□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 CYC3YAL039C 810 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 STP3YLR375W 1032 nt7.34□□□□□ -1.23
YMR226CQ05016 YNL040WYNL040W 1371 nt7.33□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 SHC1YER096W 1539 nt7.33□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 PGC1YPL206C 966 nt7.33□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 AOS1YPR180W 1044 nt7.33□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 MAM3YOL060C 2121 nt7.33□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 TCB1YOR086C 3561 nt7.33□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 YJL043WYJL043W 774 nt7.32□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 HAM1YJR069C 594 nt7.32□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 PET10YKR046C 852 nt7.32□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 IPL1YPL209C 1104 nt7.32□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 YIL108WYIL108W 2091 nt7.31□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 TPI1YDR050C 747 nt7.31□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 RMD8YFR048W 1989 nt7.31□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 ERO1YML130C 1692 nt7.31□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 NDE1YMR145C 1683 nt7.31□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 CAN1YEL063C 1773 nt7.31□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 PRE10YOR362C 867 nt7.3□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 RTC2YBR147W 891 nt7.3□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 AFG2YLR397C 2343 nt7.29□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 CAK1YFL029C 1107 nt7.29□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 YHR033WYHR033W 1272 nt7.29□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 APT1YML022W 564 nt7.29□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.29□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 MNN9YPL050C 1188 nt7.29□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 ADH7YCR105W 1086 nt7.28□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 YMR166CYMR166C 1107 nt7.28□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 FLC2YAL053W 2352 nt7.28□□□□□ -1.24
YMR226CQ05016 YPT31YER031C 672 nt7.27□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 HRA1HRA1 564 nt7.27□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 VPS65YLR322W 315 nt7.27□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 TIM50YPL063W 1431 nt7.27□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 MSS51YLR203C 1311 nt7.27□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 ARG7YMR062C 1326 nt7.27□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 HNM1YGL077C 1692 nt7.26□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 RFS1YBR052C 633 nt7.26□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 YJL045WYJL045W 1905 nt7.26□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 YEL023CYEL023C 2049 nt7.25□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 DST1YGL043W 930 nt7.25□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 CAR2YLR438W 1275 nt7.25□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 YBR232CYBR232C 360 nt7.25□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 CKI1YLR133W 1749 nt7.24□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt7.24□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 PAU15YIR041W 375 nt7.24□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 HXT13YEL069C 1695 nt7.24□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 ENB1YOL158C 1821 nt7.23□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 STF1YDL130W-A 261 nt7.23□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 RAD51YER095W 1203 nt7.23□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 RRT14YIL127C 621 nt7.23□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 NAP1YKR048C 1254 nt7.23□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 YBL111CYBL111C 2004 nt7.22□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 YDR215CYDR215C 414 nt7.22□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 PMU1YKL128C 888 nt7.22□□□□□ -1.25
YMR226CQ05016 FCP1YMR277W 2199 nt7.2□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 SER2YGR208W 930 nt7.2□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YGR210CYGR210C 1236 nt7.2□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 CPR2YHR057C 618 nt7.2□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 ECM10YEL030W 1935 nt7.19□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YDR327WYDR327W 327 nt7.19□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 PRY2YKR013W 990 nt7.19□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 BXI1YNL305C 894 nt7.19□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 LSP1YPL004C 1026 nt7.19□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 JHD1YER051W 1479 nt7.18□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 LOT6YLR011W 576 nt7.18□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 ERV25YML012W 636 nt7.18□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YAH1YPL252C 519 nt7.18□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 PPS1YBR276C 2424 nt7.17□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YCR025CYCR025C 411 nt7.17□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YGL260WYGL260W 231 nt7.17□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YPL108WYPL108W 507 nt7.17□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 HTS1YPR033C 1641 nt7.16□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YCR041WYCR041W 333 nt7.16□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt7.16□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YKL147CYKL147C 618 nt7.15□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 YPC1YBR183W 951 nt7.15□□□□□ -1.26
YMR226CQ05016 FCY2YER056C 1602 nt7.15□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.14□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 AIM2YAL049C 741 nt7.14□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 SRF1YDL133W 1314 nt7.13□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 SNF4YGL115W 969 nt7.13□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 PAC10YGR078C 600 nt7.13□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 ERG24YNL280C 1317 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.12□□□□□ -1.27
YMR226CQ05016 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.12□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 98.5 ms