Protein–RNA interactions for Protein: P53940

APJ1, J domain-containing protein APJ1, yeastyeast

Predictions only

Length 528 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
APJ1P53940 YER137CYER137C 447 nt6.68□□□□□ -1.34
APJ1P53940 YOR343CYOR343C 327 nt6.68□□□□□ -1.34
APJ1P53940 FCY1YPR062W 477 nt6.68□□□□□ -1.34
APJ1P53940 MAM3YOL060C 2121 nt6.68□□□□□ -1.34
APJ1P53940 SNU66YOR308C 1764 nt6.67□□□□□ -1.34
APJ1P53940 CKB1YGL019W 837 nt6.67□□□□□ -1.34
APJ1P53940 RSM7YJR113C 744 nt6.67□□□□□ -1.34
APJ1P53940 PMT1YDL095W 2454 nt6.67□□□□□ -1.34
APJ1P53940 GRH1YDR517W 1119 nt6.66□□□□□ -1.34
APJ1P53940 AVL9YLR114C 2295 nt6.66□□□□□ -1.34
APJ1P53940 NDE1YMR145C 1683 nt6.65□□□□□ -1.34
APJ1P53940 YGR137WYGR137W 375 nt6.65□□□□□ -1.34
APJ1P53940 EHT1YBR177C 1356 nt6.65□□□□□ -1.35
APJ1P53940 RPL12BYDR418W 498 nt6.64□□□□□ -1.35
APJ1P53940 YMR166CYMR166C 1107 nt6.64□□□□□ -1.35
APJ1P53940 YNL040WYNL040W 1371 nt6.64□□□□□ -1.35
APJ1P53940 MAS2YHR024C 1449 nt6.64□□□□□ -1.35
APJ1P53940 WSC3YOL105C 1671 nt6.64□□□□□ -1.35
APJ1P53940 MAL31YBR298C 1845 nt6.64□□□□□ -1.35
APJ1P53940 ARO3YDR035W 1113 nt6.63□□□□□ -1.35
APJ1P53940 PDC5YLR134W 1692 nt6.63□□□□□ -1.35
APJ1P53940 YKR018CYKR018C 2178 nt6.62□□□□□ -1.35
APJ1P53940 BNA3YJL060W 1335 nt6.62□□□□□ -1.35
APJ1P53940 ALG7YBR243C 1347 nt6.62□□□□□ -1.35
APJ1P53940 RCF1YML030W 480 nt6.62□□□□□ -1.35
APJ1P53940 PEX28YHR150W 1740 nt6.62□□□□□ -1.35
APJ1P53940 RUP1YOR138C 2016 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 UTR5YEL035C 501 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 YER156CYER156C 1017 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 GNA1YFL017C 480 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 HRA1HRA1 564 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 LSP1YPL004C 1026 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 TPO1YLL028W 1761 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 YIL108WYIL108W 2091 nt6.61□□□□□ -1.35
APJ1P53940 PRB1YEL060C 1908 nt6.6□□□□□ -1.35
APJ1P53940 TES1YJR019C 1050 nt6.6□□□□□ -1.35
APJ1P53940 RNA170RNA170 169 nt6.6□□□□□ -1.35
APJ1P53940 ELP6YMR312W 822 nt6.6□□□□□ -1.35
APJ1P53940 ADA2YDR448W 1305 nt6.59□□□□□ -1.35
APJ1P53940 MRP1YDR347W 966 nt6.59□□□□□ -1.35
APJ1P53940 CAK1YFL029C 1107 nt6.59□□□□□ -1.35
APJ1P53940 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt6.59□□□□□ -1.35
APJ1P53940 MET22YOL064C 1074 nt6.59□□□□□ -1.35
APJ1P53940 MTC6YHR151C 1581 nt6.59□□□□□ -1.35
APJ1P53940 OCH1YGL038C 1443 nt6.59□□□□□ -1.36
APJ1P53940 CDA1YLR307W 906 nt6.58□□□□□ -1.36
APJ1P53940 YOR041CYOR041C 432 nt6.58□□□□□ -1.36
APJ1P53940 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 SUP51tL(UAA)J 84 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 RRT14YIL127C 621 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 APT1YML022W 564 nt6.57□□□□□ -1.36
APJ1P53940 TOD6YBL054W 1578 nt6.56□□□□□ -1.36
APJ1P53940 GDH1YOR375C 1365 nt6.56□□□□□ -1.36
APJ1P53940 PDC6YGR087C 1692 nt6.55□□□□□ -1.36
APJ1P53940 AFG2YLR397C 2343 nt6.55□□□□□ -1.36
APJ1P53940 EDC2YER035W 438 nt6.55□□□□□ -1.36
APJ1P53940 SNA3YJL151C 402 nt6.55□□□□□ -1.36
APJ1P53940 RMD8YFR048W 1989 nt6.55□□□□□ -1.36
APJ1P53940 SNP1YIL061C 903 nt6.54□□□□□ -1.36
APJ1P53940 YLR460CYLR460C 1131 nt6.54□□□□□ -1.36
APJ1P53940 HXT13YEL069C 1695 nt6.54□□□□□ -1.36
APJ1P53940 SEC24YIL109C 2781 nt6.54□□□□□ -1.36
APJ1P53940 LEO1YOR123C 1395 nt6.54□□□□□ -1.36
APJ1P53940 BXI1YNL305C 894 nt6.53□□□□□ -1.36
APJ1P53940 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt6.53□□□□□ -1.36
APJ1P53940 RCF2YNR018W 675 nt6.53□□□□□ -1.36
APJ1P53940 CDC23YHR166C 1881 nt6.53□□□□□ -1.36
APJ1P53940 YBL113CYBL113C 2379 nt6.53□□□□□ -1.36
APJ1P53940 DCR2YLR361C 1737 nt6.53□□□□□ -1.36
APJ1P53940 CCR4YAL021C 2514 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 YDR306CYDR306C 1437 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 GTS1YGL181W 1191 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 YGR068W-AYGR068W-A 96 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 OLA1YBR025C 1185 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 RPS6AYPL090C 711 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 RPS6BYBR181C 711 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 ELP4YPL101W 1371 nt6.52□□□□□ -1.37
APJ1P53940 TAD2YJL035C 753 nt6.51□□□□□ -1.37
APJ1P53940 RFS1YBR052C 633 nt6.51□□□□□ -1.37
APJ1P53940 ATP2YJR121W 1536 nt6.5□□□□□ -1.37
APJ1P53940 YBL111CYBL111C 2004 nt6.5□□□□□ -1.37
APJ1P53940 CHS7YHR142W 951 nt6.5□□□□□ -1.37
APJ1P53940 FCP1YMR277W 2199 nt6.5□□□□□ -1.37
APJ1P53940 MFT1YML062C 1179 nt6.49□□□□□ -1.37
APJ1P53940 YOR268CYOR268C 399 nt6.49□□□□□ -1.37
APJ1P53940 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt6.48□□□□□ -1.37
APJ1P53940 ADE1YAR015W 921 nt6.48□□□□□ -1.37
APJ1P53940 CAN1YEL063C 1773 nt6.48□□□□□ -1.37
APJ1P53940 YJL043WYJL043W 774 nt6.47□□□□□ -1.37
APJ1P53940 KAE1YKR038C 1161 nt6.47□□□□□ -1.37
APJ1P53940 HAM1YJR069C 594 nt6.46□□□□□ -1.38
APJ1P53940 PPS1YBR276C 2424 nt6.45□□□□□ -1.38
APJ1P53940 RHO1YPR165W 630 nt6.45□□□□□ -1.38
APJ1P53940 AOS1YPR180W 1044 nt6.45□□□□□ -1.38
APJ1P53940 SHC1YER096W 1539 nt6.45□□□□□ -1.38
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 53.1 ms