Protein–RNA interactions for Protein: P53145

LSG1, Large subunit GTPase 1, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 640 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
LSG1P53145 MET13YGL125W 1803 nt7.42□□□□□ -1.22
LSG1P53145 YLR460CYLR460C 1131 nt7.41□□□□□ -1.22
LSG1P53145 ERG12YMR208W 1332 nt7.41□□□□□ -1.22
LSG1P53145 SWM1YDR260C 513 nt7.4□□□□□ -1.22
LSG1P53145 YGR210CYGR210C 1236 nt7.4□□□□□ -1.22
LSG1P53145 YIR035CYIR035C 765 nt7.4□□□□□ -1.22
LSG1P53145 YJR149WYJR149W 1215 nt7.4□□□□□ -1.22
LSG1P53145 YLR030WYLR030W 792 nt7.4□□□□□ -1.22
LSG1P53145 TIF3YPR163C 1311 nt7.4□□□□□ -1.22
LSG1P53145 MEP1YGR121C 1479 nt7.4□□□□□ -1.22
LSG1P53145 PUS7YOR243C 2031 nt7.39□□□□□ -1.23
LSG1P53145 HSM3YBR272C 1443 nt7.39□□□□□ -1.23
LSG1P53145 BUB2YMR055C 921 nt7.39□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YNL140CYNL140C 570 nt7.39□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YKR018CYKR018C 2178 nt7.39□□□□□ -1.23
LSG1P53145 PRB1YEL060C 1908 nt7.39□□□□□ -1.23
LSG1P53145 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.38□□□□□ -1.23
LSG1P53145 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.38□□□□□ -1.23
LSG1P53145 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.38□□□□□ -1.23
LSG1P53145 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.38□□□□□ -1.23
LSG1P53145 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.38□□□□□ -1.23
LSG1P53145 MEU1YLR017W 1014 nt7.38□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YMR007WYMR007W 381 nt7.38□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YNR001W-AYNR001W-A 219 nt7.37□□□□□ -1.23
LSG1P53145 RSC9YML127W 1746 nt7.37□□□□□ -1.23
LSG1P53145 PPZ2YDR436W 2133 nt7.37□□□□□ -1.23
LSG1P53145 TOS2YGR221C 1869 nt7.36□□□□□ -1.23
LSG1P53145 BUD31YCR063W 474 nt7.36□□□□□ -1.23
LSG1P53145 CHS7YHR142W 951 nt7.36□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YIA6YIL006W 1122 nt7.36□□□□□ -1.23
LSG1P53145 RCR1YBR005W 642 nt7.36□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YPL108WYPL108W 507 nt7.36□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YJL045WYJL045W 1905 nt7.36□□□□□ -1.23
LSG1P53145 INO1YJL153C 1602 nt7.35□□□□□ -1.23
LSG1P53145 TOD6YBL054W 1578 nt7.35□□□□□ -1.23
LSG1P53145 GLY1YEL046C 1164 nt7.35□□□□□ -1.23
LSG1P53145 YMR166CYMR166C 1107 nt7.35□□□□□ -1.23
LSG1P53145 RFS1YBR052C 633 nt7.35□□□□□ -1.23
LSG1P53145 FCY1YPR062W 477 nt7.35□□□□□ -1.23
LSG1P53145 INM1YHR046C 888 nt7.33□□□□□ -1.24
LSG1P53145 RIB1YBL033C 1038 nt7.33□□□□□ -1.24
LSG1P53145 OLA1YBR025C 1185 nt7.33□□□□□ -1.24
LSG1P53145 MRN1YPL184C 1839 nt7.33□□□□□ -1.24
LSG1P53145 SMC5YOL034W 3282 nt7.33□□□□□ -1.24
LSG1P53145 TGL5YOR081C 2250 nt7.32□□□□□ -1.24
LSG1P53145 LRO1YNR008W 1986 nt7.3□□□□□ -1.24
LSG1P53145 MAL31YBR298C 1845 nt7.3□□□□□ -1.24
LSG1P53145 TDA4YJR116W 840 nt7.3□□□□□ -1.24
LSG1P53145 MET22YOL064C 1074 nt7.3□□□□□ -1.24
LSG1P53145 SRF1YDL133W 1314 nt7.29□□□□□ -1.24
LSG1P53145 OCH1YGL038C 1443 nt7.29□□□□□ -1.24
LSG1P53145 CAK1YFL029C 1107 nt7.29□□□□□ -1.24
LSG1P53145 SOD2YHR008C 702 nt7.29□□□□□ -1.24
LSG1P53145 LSP1YPL004C 1026 nt7.29□□□□□ -1.24
LSG1P53145 PRP2YNR011C 2631 nt7.29□□□□□ -1.24
LSG1P53145 EMP65YER140W 1671 nt7.28□□□□□ -1.24
LSG1P53145 RRT14YIL127C 621 nt7.28□□□□□ -1.24
LSG1P53145 SEC24YIL109C 2781 nt7.27□□□□□ -1.25
LSG1P53145 DIP5YPL265W 1827 nt7.27□□□□□ -1.25
LSG1P53145 PDC6YGR087C 1692 nt7.27□□□□□ -1.25
LSG1P53145 TPO1YLL028W 1761 nt7.26□□□□□ -1.25
LSG1P53145 EHT1YBR177C 1356 nt7.26□□□□□ -1.25
LSG1P53145 TPK1YJL164C 1194 nt7.26□□□□□ -1.25
LSG1P53145 KTR4YBR199W 1395 nt7.25□□□□□ -1.25
LSG1P53145 YJL160CYJL160C 864 nt7.25□□□□□ -1.25
LSG1P53145 HMS2YJR147W 1077 nt7.25□□□□□ -1.25
LSG1P53145 RNA170RNA170 169 nt7.25□□□□□ -1.25
LSG1P53145 SGE1YPR198W 1632 nt7.25□□□□□ -1.25
LSG1P53145 ADE17YMR120C 1779 nt7.25□□□□□ -1.25
LSG1P53145 ECM30YLR436C 3825 nt7.23□□□□□ -1.25
LSG1P53145 GNA1YFL017C 480 nt7.23□□□□□ -1.25
LSG1P53145 MRP7YNL005C 1116 nt7.23□□□□□ -1.25
LSG1P53145 HRA1HRA1 564 nt7.22□□□□□ -1.25
LSG1P53145 RCF1YML030W 480 nt7.22□□□□□ -1.25
LSG1P53145 WSC3YOL105C 1671 nt7.22□□□□□ -1.25
LSG1P53145 CRN1YLR429W 1956 nt7.21□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.21□□□□□ -1.26
LSG1P53145 RHO1YPR165W 630 nt7.21□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YPT31YER031C 672 nt7.2□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YGR137WYGR137W 375 nt7.2□□□□□ -1.26
LSG1P53145 RQC1YDR333C 2172 nt7.2□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YPR084WYPR084W 1371 nt7.2□□□□□ -1.26
LSG1P53145 PET18YCR020C 648 nt7.19□□□□□ -1.26
LSG1P53145 ARO3YDR035W 1113 nt7.19□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YER156CYER156C 1017 nt7.19□□□□□ -1.26
LSG1P53145 MFT1YML062C 1179 nt7.19□□□□□ -1.26
LSG1P53145 CLN1YMR199W 1641 nt7.19□□□□□ -1.26
LSG1P53145 RMD8YFR048W 1989 nt7.19□□□□□ -1.26
LSG1P53145 RRN10YBL025W 438 nt7.18□□□□□ -1.26
LSG1P53145 Q0010Q0010 387 nt7.18□□□□□ -1.26
LSG1P53145 ALG7YBR243C 1347 nt7.18□□□□□ -1.26
LSG1P53145 PUP3YER094C 618 nt7.17□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YMR206WYMR206W 942 nt7.17□□□□□ -1.26
LSG1P53145 PMT1YDL095W 2454 nt7.17□□□□□ -1.26
LSG1P53145 THI73YLR004C 1572 nt7.16□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YIP4YGL198W 708 nt7.16□□□□□ -1.26
LSG1P53145 YOR041CYOR041C 432 nt7.16□□□□□ -1.26
LSG1P53145 SKY1YMR216C 2229 nt7.16□□□□□ -1.26
LSG1P53145 GTS1YGL181W 1191 nt7.14□□□□□ -1.27
LSG1P53145 BXI1YNL305C 894 nt7.14□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 11.3 ms