Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC19.27■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Stfa1P35175 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Stfa1P35175 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Stfa1P35175 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Stfa1P35175 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stfa1P35175 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stfa1P35175 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stfa1P35175 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Stfa1P35175 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stfa1P35175 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Stfa1P35175 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Stfa1P35175 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms