Protein–RNA interactions for Protein: P35175

Stfa1, Stefin-1, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stfa1P35175 Gm25239-201ENSMUST00000174915 86 ntBASIC30.7■■■□□ 2.51
Stfa1P35175 Smc2os-201ENSMUST00000141473 626 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Stfa1P35175 1810037I17Rik-201ENSMUST00000106429 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Stfa1P35175 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Stfa1P35175 Necab2-201ENSMUST00000098363 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Stfa1P35175 Khdrbs3-201ENSMUST00000022954 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Stfa1P35175 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
Stfa1P35175 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Stfa1P35175 Kcnmb4-201ENSMUST00000068233 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Stfa1P35175 Cacng8-202ENSMUST00000182222 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Stfa1P35175 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stfa1P35175 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Stfa1P35175 Gm23366-201ENSMUST00000175022 89 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Stfa1P35175 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Stfa1P35175 Plekho1-201ENSMUST00000015889 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stfa1P35175 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Stfa1P35175 B330016D10Rik-201ENSMUST00000049927 1701 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Stfa1P35175 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Stfa1P35175 Ankrd40-202ENSMUST00000051221 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Stfa1P35175 Zic2-201ENSMUST00000075888 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Stfa1P35175 Trnp1-202ENSMUST00000125541 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Stfa1P35175 Rhno1-201ENSMUST00000057421 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stfa1P35175 Tusc1-201ENSMUST00000066774 1374 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Stfa1P35175 Hnrnpd-201ENSMUST00000019128 2000 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Stfa1P35175 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Stfa1P35175 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Stfa1P35175 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Stfa1P35175 Ybx2-201ENSMUST00000018698 1673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Stfa1P35175 Hoxd8-202ENSMUST00000074721 1758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Stfa1P35175 4930537H20Rik-201ENSMUST00000200437 1683 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Stfa1P35175 Pabpn1-207ENSMUST00000150975 1775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Stfa1P35175 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Stfa1P35175 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Stfa1P35175 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Stfa1P35175 Ppp2r5c-206ENSMUST00000222276 1802 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Stfa1P35175 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Stfa1P35175 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Stfa1P35175 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Stfa1P35175 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Stfa1P35175 Mbd2-201ENSMUST00000074058 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Stfa1P35175 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Stfa1P35175 Pabpn1-202ENSMUST00000116476 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Stfa1P35175 Rrnad1-207ENSMUST00000160143 1568 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Stfa1P35175 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stfa1P35175 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Stfa1P35175 Six2-202ENSMUST00000163568 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Stfa1P35175 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Stfa1P35175 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Stfa1P35175 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Stfa1P35175 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Stfa1P35175 Rnf126-201ENSMUST00000047203 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Stfa1P35175 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Stfa1P35175 Rab12-201ENSMUST00000070538 2057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Stfa1P35175 Sh3glb2-204ENSMUST00000113621 1851 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stfa1P35175 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stfa1P35175 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Stfa1P35175 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Stfa1P35175 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Stfa1P35175 Wtip-201ENSMUST00000038537 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Stfa1P35175 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stfa1P35175 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Stfa1P35175 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Stfa1P35175 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stfa1P35175 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Stfa1P35175 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Stfa1P35175 Nfix-202ENSMUST00000099070 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Stfa1P35175 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Stfa1P35175 Poldip2-201ENSMUST00000001127 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Stfa1P35175 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Stfa1P35175 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Stfa1P35175 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Stfa1P35175 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Stfa1P35175 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Stfa1P35175 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Stfa1P35175 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Stfa1P35175 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Stfa1P35175 Cdk9-201ENSMUST00000009699 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Stfa1P35175 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Stfa1P35175 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Stfa1P35175 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Stfa1P35175 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Stfa1P35175 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Stfa1P35175 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Stfa1P35175 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Stfa1P35175 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Stfa1P35175 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stfa1P35175 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Stfa1P35175 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Stfa1P35175 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Stfa1P35175 Nkx3-2-201ENSMUST00000060820 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Stfa1P35175 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Stfa1P35175 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Stfa1P35175 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Stfa1P35175 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Stfa1P35175 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Stfa1P35175 Rab12-205ENSMUST00000167962 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stfa1P35175 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stfa1P35175 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stfa1P35175 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stfa1P35175 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms