Protein–RNA interactions for Protein: P28653

Bgn, Biglycan, mousemouse

Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BgnP28653 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BgnP28653 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BgnP28653 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
BgnP28653 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BgnP28653 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BgnP28653 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
BgnP28653 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
BgnP28653 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
BgnP28653 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BgnP28653 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BgnP28653 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BgnP28653 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
BgnP28653 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
BgnP28653 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
BgnP28653 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BgnP28653 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BgnP28653 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
BgnP28653 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
BgnP28653 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BgnP28653 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
BgnP28653 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BgnP28653 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
BgnP28653 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
BgnP28653 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BgnP28653 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BgnP28653 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BgnP28653 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
BgnP28653 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
BgnP28653 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BgnP28653 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BgnP28653 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
BgnP28653 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
BgnP28653 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
BgnP28653 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
BgnP28653 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BgnP28653 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BgnP28653 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
BgnP28653 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BgnP28653 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
BgnP28653 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BgnP28653 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
BgnP28653 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
BgnP28653 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BgnP28653 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
BgnP28653 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
BgnP28653 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BgnP28653 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
BgnP28653 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BgnP28653 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
BgnP28653 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BgnP28653 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
BgnP28653 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BgnP28653 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BgnP28653 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BgnP28653 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
BgnP28653 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
BgnP28653 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BgnP28653 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BgnP28653 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BgnP28653 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BgnP28653 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BgnP28653 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
BgnP28653 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
BgnP28653 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BgnP28653 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
BgnP28653 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BgnP28653 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
BgnP28653 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BgnP28653 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BgnP28653 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BgnP28653 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BgnP28653 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BgnP28653 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
BgnP28653 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
BgnP28653 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
BgnP28653 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
BgnP28653 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BgnP28653 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
BgnP28653 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BgnP28653 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BgnP28653 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BgnP28653 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BgnP28653 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
BgnP28653 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BgnP28653 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
BgnP28653 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BgnP28653 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.29■■□□□ 1
BgnP28653 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
BgnP28653 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BgnP28653 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BgnP28653 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
BgnP28653 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.1 ms