Protein–RNA interactions for Protein: P26043

Rdx, Radixin, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 583 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RdxP26043 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RdxP26043 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RdxP26043 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RdxP26043 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
RdxP26043 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RdxP26043 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
RdxP26043 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RdxP26043 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
RdxP26043 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RdxP26043 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
RdxP26043 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
RdxP26043 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RdxP26043 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
RdxP26043 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RdxP26043 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
RdxP26043 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
RdxP26043 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RdxP26043 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
RdxP26043 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
RdxP26043 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
RdxP26043 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RdxP26043 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
RdxP26043 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
RdxP26043 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
RdxP26043 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RdxP26043 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
RdxP26043 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RdxP26043 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RdxP26043 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RdxP26043 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
RdxP26043 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RdxP26043 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
RdxP26043 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
RdxP26043 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RdxP26043 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RdxP26043 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RdxP26043 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RdxP26043 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
RdxP26043 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RdxP26043 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
RdxP26043 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RdxP26043 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RdxP26043 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RdxP26043 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
RdxP26043 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
RdxP26043 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
RdxP26043 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
RdxP26043 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
RdxP26043 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RdxP26043 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RdxP26043 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RdxP26043 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
RdxP26043 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RdxP26043 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RdxP26043 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
RdxP26043 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RdxP26043 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RdxP26043 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
RdxP26043 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RdxP26043 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
RdxP26043 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RdxP26043 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RdxP26043 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
RdxP26043 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
RdxP26043 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
RdxP26043 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RdxP26043 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RdxP26043 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RdxP26043 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
RdxP26043 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RdxP26043 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RdxP26043 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
RdxP26043 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RdxP26043 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RdxP26043 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
RdxP26043 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RdxP26043 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RdxP26043 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
RdxP26043 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RdxP26043 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RdxP26043 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RdxP26043 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
RdxP26043 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
RdxP26043 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
RdxP26043 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.8 ms