Protein–RNA interactions for Protein: O88351

Ikbkb, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 757 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IkbkbO88351 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
IkbkbO88351 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
IkbkbO88351 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
IkbkbO88351 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
IkbkbO88351 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
IkbkbO88351 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
IkbkbO88351 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
IkbkbO88351 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms