Protein–RNA interactions for Protein: O35955

Psmb10, Proteasome subunit beta type-10, mousemouse

Predictions only

Length 273 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb10O35955 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Psmb10O35955 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Psmb10O35955 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Psmb10O35955 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Psmb10O35955 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms