Protein–RNA interactions for Protein: F2YMG0

Prss56, Serine protease 56, mousemouse

Predictions only

Length 604 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss56F2YMG0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Prss56F2YMG0 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Prss56F2YMG0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Prss56F2YMG0 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms