Protein–RNA interactions for Protein: A2RSL7

4931406B18Rik, RIKEN cDNA 4931406B18 gene, mousemouse

Predictions only

Length 367 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4931406B18RikA2RSL7 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
4931406B18RikA2RSL7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4931406B18RikA2RSL7 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
4931406B18RikA2RSL7 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
4931406B18RikA2RSL7 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
4931406B18RikA2RSL7 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.5 ms