Protein–RNA interactions for Protein: A2AGU5

Cldn34d, Claudin 34D, mousemouse

Predictions only

Length 210 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34dA2AGU5 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Cldn34dA2AGU5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cldn34dA2AGU5 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Cldn34dA2AGU5 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Cldn34dA2AGU5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.6 ms