Protein–RNA interactions for Protein: A2ABG4

Tbc1d16, TBC1 domain family, member 16, mousemouse

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tbc1d16A2ABG4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Tbc1d16A2ABG4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Tbc1d16A2ABG4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Tbc1d16A2ABG4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Tbc1d16A2ABG4 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Tbc1d16A2ABG4 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms