Protein–RNA interactions for Protein: A0A0N4SVR5

Rasgef1a, RasGEF domain family, member 1A, mousemouse

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Length 498 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Rasgef1aA0A0N4SVR5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
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Rasgef1aA0A0N4SVR5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Rasgef1aA0A0N4SVR5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
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