Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 CBWD4P-201ENST00000445695 655 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL353148.1-203ENST00000452286 665 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RNU7-95P-201ENST00000459222 64 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC104435.1-201ENST00000483483 166 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 RPL21P47-201ENST00000483696 477 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC104564.1-201ENST00000493028 407 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MTCO2P9-201ENST00000503214 694 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 SKP1-208ENST00000521216 899 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC025034.1-201ENST00000552778 1711 ntTSL 3 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MIR5089-201ENST00000580047 84 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC011468.4-201ENST00000603942 409 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC005156.1-201ENST00000613371 573 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 PVT1_3.1-201ENST00000620853 95 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 OR8K3-202ENST00000623845 939 ntAPPRIS P1 BASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC244517.1-201ENST00000606030 2086 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC006378.2-201ENST00000623178 2476 ntBASIC2.89□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 CUL3-203ENST00000409096 2701 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC110774.1-201ENST00000623567 2018 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 SERPINI2-206ENST00000471111 1331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MFSD8-213ENST00000641134 1327 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 KCNIP4-IT1-201ENST00000627566 9848 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MTND5P3-201ENST00000438536 1800 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 HNRNPDP2-201ENST00000406475 478 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC009411.1-202ENST00000412424 548 ntTSL 4 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 PRELID3BP11-201ENST00000414230 479 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL596247.1-201ENST00000416076 442 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AF241725.1-201ENST00000416182 480 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL358453.1-201ENST00000422522 250 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL357833.2-201ENST00000426811 430 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC093422.3-201ENST00000428506 305 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC129850.1-201ENST00000436203 508 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MIR4435-2HG-213ENST00000451884 423 ntTSL 3 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 HMGB3P30-201ENST00000457863 606 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 TOMM22P6-201ENST00000465035 409 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL162742.2-201ENST00000472915 244 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 C4orf33-204ENST00000502887 1126 ntTSL 1 (best) BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 GZMAP1-201ENST00000503054 631 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC090071.1-201ENST00000507713 644 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 SNORA25.15-201ENST00000516487 89 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 LINC01495-201ENST00000532380 421 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC097717.1-211ENST00000600604 687 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AP000873.2-201ENST00000602381 406 ntTSL 2 BASIC2.88□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 AC096586.1-201ENST00000610267 561 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 STMN1P1-201ENST00000617809 440 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC092650.2-201ENST00000619984 902 ntBASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC2.88□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 LIFR-201ENST00000263409 10089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 OR8K5-201ENST00000313447 924 ntAPPRIS P1 BASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 AC246680.2-201ENST00000422106 389 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC073310.1-201ENST00000423226 1033 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 AP003717.3-201ENST00000544832 1180 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC114546.1-201ENST00000560140 473 ntTSL 3 BASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 MIR6734-201ENST00000621166 68 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 SEC63P2-201ENST00000503863 1939 ntBASIC2.87□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 HSPE1P26-201ENST00000405341 275 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 SEMA6A-AS2-201ENST00000508766 482 ntTSL 3 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC008562.1-201ENST00000521763 330 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
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PTPRTO14522 AL353811.1-201ENST00000602851 736 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AL133393.1-201ENST00000603277 287 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AP005229.2-201ENST00000609980 697 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 AC017104.5-201ENST00000637647 639 ntBASIC2.86□□□□□ -1.95
PTPRTO14522 CAPZA2-215ENST00000639546 129 ntTSL 5 BASIC2.86□□□□□ -1.95
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