Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 AP001148.1-201ENST00000624124 2359 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 C11orf40-201ENST00000307616 654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU1-133P-201ENST00000364867 167 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 OR1A2-201ENST00000381951 930 ntAPPRIS P1 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU6-328P-201ENST00000390887 106 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL512430.2-201ENST00000406786 339 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 BACH1-IT3-201ENST00000429843 406 ntTSL 2 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC025033.1-201ENST00000463883 194 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC107015.1-201ENST00000466902 747 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC016573.1-201ENST00000523205 539 ntTSL 3 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL160237.3-201ENST00000604114 1013 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC068631.1-219ENST00000625826 668 ntTSL 5 BASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 Z82195.2-201ENST00000612348 18351 ntBASIC1.44□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 HAS2-201ENST00000303924 4190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 POLK-204ENST00000504026 1484 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MIR517C-201ENST00000385103 95 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPL23AP29-201ENST00000397284 453 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU6ATAC16P-201ENST00000408591 138 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 EIF1AXP1-201ENST00000419267 435 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MTND2P9-201ENST00000422293 931 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPS6P15-201ENST00000431996 751 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL157827.1-201ENST00000447622 132 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC026780.2-201ENST00000503489 730 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 UCHL1-AS1-201ENST00000507190 592 ntTSL 4 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC021146.7-201ENST00000509604 775 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNA5SP402-201ENST00000517148 110 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MTCYBP19-201ENST00000517463 1124 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 CACNA1C-IT2-201ENST00000541871 589 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 IGKV1-33-202ENST00000558152 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC007229.1-201ENST00000590455 412 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 IGKV1D-33-202ENST00000611734 324 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RUFY2-201ENST00000265865 2033 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 DENND4A-209ENST00000635620 5887 ntTSL 5 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNA5SP160-201ENST00000364866 120 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU6-1080P-201ENST00000383982 107 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 U3.37-201ENST00000408528 213 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 ELF3-AS1-201ENST00000415582 500 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL445687.1-201ENST00000439946 251 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 APOA2-210ENST00000491350 263 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 LINC02377-201ENST00000500169 450 ntTSL 3 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AP003128.1-201ENST00000531414 448 ntTSL 2 BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC012150.2-201ENST00000621300 544 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC073348.1-201ENST00000623002 331 ntBASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 NEDD4-205ENST00000506154 6751 ntTSL 1 (best) BASIC1.43□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 SERPINI2-201ENST00000264677 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU4-13P-201ENST00000364019 141 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 FNDC3CP-201ENST00000420795 1155 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 NEK4P1-201ENST00000433383 879 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 LINC01474-202ENST00000449235 628 ntTSL 3 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC105245.1-201ENST00000581934 244 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL591441.2-201ENST00000620059 535 ntTSL 5 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AP001005.3-201ENST00000622049 129 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC025539.1-201ENST00000515343 4019 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 UEVLD-208ENST00000535484 1963 ntTSL 2 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 SI-201ENST00000264382 6011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MYSM1-208ENST00000622766 6020 ntTSL 1 (best) BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC019155.1-201ENST00000382242 574 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 USP9YP27-201ENST00000418455 438 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL645568.3-201ENST00000433683 316 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 TIPARP-AS1-202ENST00000478005 554 ntTSL 4 BASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 SUB1P4-201ENST00000566062 339 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MIR4506-201ENST00000584693 77 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 5S_rRNA.12-201ENST00000617631 107 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 Clostridiales-1.2-201ENST00000636724 160 ntBASIC1.42□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 MTCYBP12-201ENST00000440559 1134 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 LINC01549-201ENST00000440664 714 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNU6-1132P-201ENST00000459214 107 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC109464.2-201ENST00000510242 943 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 C1GALT1P2-201ENST00000510813 1104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC010451.2-201ENST00000511514 545 ntTSL 4 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC098850.3-201ENST00000577569 771 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 LIVAR-201ENST00000578633 384 ntTSL 3 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC124283.4-201ENST00000581815 456 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 ABI1P1-201ENST00000603375 1120 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RNA5SP138-201ENST00000365098 114 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 Y_RNA.412-201ENST00000384001 104 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RWDD4P2-201ENST00000426392 563 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AL365400.1-201ENST00000431854 640 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 VN1R96P-201ENST00000446052 858 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RPL23AP62-201ENST00000463396 453 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 RWDD4P1-201ENST00000488019 565 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 HMGN1P28-201ENST00000521340 364 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 DUXAP5-201ENST00000529668 529 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC074029.2-201ENST00000551045 634 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC024560.3-201ENST00000608482 349 ntBASIC1.41□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 AC009812.4-201ENST00000569134 1805 ntBASIC1.4□□□□□ -2.18
PTPN13Q12923 NFIA-AS1-201ENST00000442027 384 ntTSL 2 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC00374-201ENST00000454780 800 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 RPL9P9-202ENST00000466501 579 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 FABP5P6-201ENST00000510588 409 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC009563.1-202ENST00000523365 643 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AP003049.2-202ENST00000532929 803 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC008126.1-201ENST00000549019 480 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC104229.1-201ENST00000561364 255 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 LINC01919-202ENST00000579506 384 ntTSL 3 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 AC007953.2-201ENST00000603299 193 ntTSL 5 BASIC1.4□□□□□ -2.19
PTPN13Q12923 KATNBL1P1-201ENST00000605192 748 ntBASIC1.4□□□□□ -2.19
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