Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 RPL21P136-201ENST00000605378 396 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL163051.2-201ENST00000618976 735 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL161616.2-201ENST00000622001 565 ntTSL 4 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC083865.1-201ENST00000636634 831 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ATP13A3-201ENST00000256031 7322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 FAM35CP-201ENST00000554755 2470 ntBASIC2.96□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 CPXCR1-203ENST00000614120 1485 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ATP6V1G3-201ENST00000281087 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RNU6-792P-201ENST00000363490 107 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 Y_RNA.295-201ENST00000364918 102 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SPHAR-201ENST00000366688 648 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MTND4P13-201ENST00000402078 1023 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RPS7P5-201ENST00000441482 581 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC064871.1-201ENST00000444562 427 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RPS15AP17-201ENST00000470598 390 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC008628.1-201ENST00000508663 265 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC104986.1-201ENST00000517978 436 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC025524.2-211ENST00000519990 1173 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 IGHVIII-5-1-201ENST00000523059 99 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC055878.1-201ENST00000531858 281 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC087241.2-201ENST00000535801 324 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL157911.1-202ENST00000554123 502 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL353708.2-201ENST00000567486 447 ntTSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR4458-201ENST00000578872 75 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 WISP1-OT1-201ENST00000602893 642 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC098483.2-201ENST00000603158 454 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC026741.1-201ENST00000605892 482 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC011374.2-201ENST00000607135 526 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC097460.3-201ENST00000623099 442 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL359740.1-201ENST00000624340 592 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC130466.1-201ENST00000636354 4683 ntTSL 5 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC008163.1-205ENST00000413944 4649 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 EBAG9-210ENST00000620557 2186 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC010329.2-201ENST00000595195 2737 ntBASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 CCDC54-201ENST00000261058 1444 ntAPPRIS P1 BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 PLCZ1-209ENST00000539875 1398 ntTSL 1 (best) BASIC2.95□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 PYGO1-201ENST00000302000 8488 ntTSL 1 (best) BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MT-ND3-201ENST00000361227 346 ntAPPRIS P1 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RNU6-481P-201ENST00000384194 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SNORA40.4-201ENST00000390971 128 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SNORA67.5-201ENST00000391036 107 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 CD3D-202ENST00000392884 476 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC005165.1-203ENST00000423689 1281 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MTCO2P1-201ENST00000424648 477 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RPL7P55-201ENST00000450522 746 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC011196.1-201ENST00000451816 595 ntTSL 2 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AP000873.1-201ENST00000463987 400 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC010683.1-201ENST00000473673 378 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC023050.1-201ENST00000498198 304 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RPL23AP63-201ENST00000498752 471 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LNX1-AS2-201ENST00000502410 347 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC01612-201ENST00000504509 469 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RAC1P5-201ENST00000512182 576 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MTCO1P30-201ENST00000515244 580 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC090539.1-201ENST00000523907 434 ntTSL 3 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL136520.1-202ENST00000555494 763 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC010678.1-201ENST00000614118 713 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AP003072.4-201ENST00000624580 310 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SATB1-AS1-237ENST00000626982 735 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 KIAA1107-201ENST00000370378 4622 ntTSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 FSIP2-202ENST00000424728 20788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MTCO1P18-201ENST00000455518 1419 ntBASIC2.94□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC01967-201ENST00000356047 755 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 EFCAB14-AS1-201ENST00000418985 491 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MTCO1P43-201ENST00000431831 488 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 NRG3-AS1-201ENST00000448936 555 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AL035407.2-201ENST00000454090 378 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LNCSRLR-201ENST00000490375 709 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC02066-201ENST00000492731 580 ntTSL 4 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC01333-201ENST00000508083 724 ntTSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 SNORD116-26-201ENST00000516006 96 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC012413.1-201ENST00000521294 519 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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PTPRTO14522 AC021698.1-201ENST00000524858 716 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC02305-201ENST00000554142 476 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR4255-201ENST00000579351 72 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MIR4716-201ENST00000579628 84 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 HMGN2P28-201ENST00000606102 262 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC073569.3-201ENST00000619055 682 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 ZBBX-205ENST00000455345 3185 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 C1D-201ENST00000355848 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 CFHR4-202ENST00000367416 2178 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LRRC39-201ENST00000342895 1881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 NME5-201ENST00000265191 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 METTL21EP-201ENST00000298105 713 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 PGAP1-203ENST00000409188 1246 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 UBE2V1P11-201ENST00000411559 285 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RAD23BP2-201ENST00000416003 1207 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC008173.1-201ENST00000418901 264 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AP001117.1-201ENST00000428205 609 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 LINC01359-202ENST00000436350 710 ntTSL 3 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 Z73417.1-201ENST00000447373 778 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC078857.1-201ENST00000469870 667 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 PDCD10-216ENST00000492396 814 ntTSL 5 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 RPL30P11-201ENST00000495304 339 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC069439.2-201ENST00000496403 789 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 MTATP6P22-201ENST00000507369 598 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC112518.2-201ENST00000508565 425 ntBASIC2.93□□□□□ -1.94
PTPRTO14522 AC093772.1-201ENST00000513519 506 ntTSL 2 BASIC2.93□□□□□ -1.94
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