Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AP003117.1-201ENST00000602771 554 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 PLSCR2-206ENST00000610787 1001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC091834.1-201ENST00000614543 472 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 CC2D2B-209ENST00000618242 980 ntTSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL355578.1-201ENST00000607405 1328 ntBASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RASSF8-210ENST00000541490 5505 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC3.06□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 GNPDA2-204ENST00000509756 5382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SOCS4-201ENST00000339298 6667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 DEFB112-201ENST00000322246 342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU4-74P-201ENST00000411280 161 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL590727.1-201ENST00000418652 771 ntTSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RPL39L-202ENST00000433055 749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LINC01317-202ENST00000442026 677 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC009237.8-201ENST00000445492 379 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 snoZ278.1-201ENST00000517059 112 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SMARCE1P4-201ENST00000523647 241 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC074052.2-201ENST00000562516 214 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC079148.1-201ENST00000565944 819 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LINC01928-201ENST00000591029 504 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RPAP2P1-201ENST00000603626 1168 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC018618.2-201ENST00000604770 446 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL627309.6-201ENST00000606857 840 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AF230666.1-202ENST00000608375 870 ntTSL 5 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL354810.1-201ENST00000618134 635 ntTSL 3 BASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL445493.3-201ENST00000619568 477 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC010297.1-201ENST00000623948 149 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL356094.1-201ENST00000624663 1212 ntBASIC3.05□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC096656.1-201ENST00000623826 1364 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNA5SP190-201ENST00000365222 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 CFHR2-201ENST00000367415 1059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SNORA26.7-201ENST00000391288 122 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR1303-201ENST00000408625 86 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC095032.2-201ENST00000414923 418 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC023128.2-201ENST00000420880 1223 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RPL17P35-201ENST00000432217 549 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SETP8-201ENST00000435341 628 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC097499.1-201ENST00000444277 208 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AP1S3-208ENST00000446015 499 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 TTTY19-201ENST00000453955 269 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC104012.1-201ENST00000517848 719 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AP003110.1-201ENST00000526976 717 ntTSL 1 (best) BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC087623.1-201ENST00000533301 377 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC103681.1-202ENST00000534342 449 ntTSL 3 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 LINC02258-201ENST00000551280 777 ntTSL 2 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AMZ2P1-203ENST00000565833 850 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC091563.1-202ENST00000574086 522 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR3670-2-201ENST00000582974 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR3670-1-201ENST00000584160 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR3670-3-201ENST00000584855 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC104365.3-201ENST00000587011 625 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC008764.5-201ENST00000597851 190 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 ZNF92P2-201ENST00000600543 1059 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL671309.1-201ENST00000603750 544 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 KATNBL1P5-201ENST00000605015 517 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL355816.1-201ENST00000607951 118 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MIR3670-4-201ENST00000612260 65 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC073592.7-201ENST00000623659 507 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC010872.1-201ENST00000624225 675 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC245427.3-201ENST00000632041 51 ntAPPRIS P1 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SNX16-212ENST00000615066 1918 ntTSL 5 BASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC007256.1-201ENST00000392253 2765 ntBASIC3.04□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 POLK-217ENST00000515295 1438 ntTSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 IL36B-202ENST00000327407 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNY1-201ENST00000364228 113 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNA5SP167-201ENST00000365461 116 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU6ATAC38P-201ENST00000408119 126 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 CTNNA2-204ENST00000409266 432 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 RNU2-72P-201ENST00000411175 163 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC010723.1-201ENST00000435111 540 ntTSL 3 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MED6P1-201ENST00000439659 713 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AC016903.1-201ENST00000444017 588 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 MTND2P8-201ENST00000450555 1025 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRTO14522 AC098617.1-216ENST00000602099 708 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRTO14522 AC019080.3-201ENST00000606180 444 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 BX248123.2-201ENST00000606318 124 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 PRKCQ-AS1-213ENST00000613985 883 ntTSL 5 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 U6.48-201ENST00000618523 106 ntBASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 AL596220.1-201ENST00000622121 542 ntTSL 4 BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 SENP7-201ENST00000314261 4736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
PTPRTO14522 IDE-201ENST00000265986 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.03□□□□□ -1.92
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PTPRTO14522 DEFB133-201ENST00000398721 186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC019129.1-201ENST00000403786 261 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 PTGES3P2-201ENST00000407942 482 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC019070.1-201ENST00000415008 1024 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 LINC01347-201ENST00000417964 355 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AL645937.4-201ENST00000419702 389 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 SDR42E1P3-201ENST00000438345 502 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC078883.3-201ENST00000458314 512 ntTSL 2 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 RPS26P21-201ENST00000475397 348 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AP002340.1-201ENST00000529298 285 ntTSL 3 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC079035.1-201ENST00000551713 848 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC005951.1-201ENST00000576706 485 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC012594.1-269ENST00000600489 628 ntTSL 5 BASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 AC091488.1-201ENST00000604239 660 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 MIR7973-1-201ENST00000614683 76 ntBASIC3.02□□□□□ -1.93
PTPRTO14522 CHD9-202ENST00000398510 11337 ntTSL 1 (best) BASIC3.02□□□□□ -1.93
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