Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKI3

VPREB3, Pre-B lymphocyte protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 123 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB3Q9UKI3 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 TSPY23P-201ENST00000440136 739 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 HMOX2-208ENST00000570646 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 PHOSPHO1-201ENST00000310544 1816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 KRT18-207ENST00000550600 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SYT5-202ENST00000537500 2612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
VPREB3Q9UKI3 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AVL9-209ENST00000640103 1367 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 C11orf49-201ENST00000278460 1645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ZFC3H1-206ENST00000548100 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 POLD2-201ENST00000223361 1597 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 PTAR1-205ENST00000472967 1689 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ETV4-204ENST00000545089 1628 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GPR139-202ENST00000570682 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RFC2-213ENST00000621097 1635 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ZNF436-AS1-206ENST00000518821 461 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 DNAJB5-203ENST00000453597 2589 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 KREMEN2-201ENST00000303746 2326 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 RAB11FIP4-201ENST00000394744 1968 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MTX1-202ENST00000368376 1632 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 BRSK2-208ENST00000528841 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SCRT1-201ENST00000569446 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MOK-201ENST00000361847 1940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
VPREB3Q9UKI3 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 83.8 ms