Protein–RNA interactions for Protein: P29974

Cnga1, cGMP-gated cation channel alpha-1, mousemouse

Predictions only

Length 684 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnga1P29974 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Cnga1P29974 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Kcnn1-207ENSMUST00000212509 1608 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Cnga1P29974 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 329.4 ms