Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z5U6

WDR53, WD repeat-containing protein 53, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
WDR53Q7Z5U6 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ACADS-202ENST00000411593 1398 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CD8B-203ENST00000390655 1417 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RPH3A-203ENST00000543106 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AMACR-206ENST00000502637 1598 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SAAL1-202ENST00000524803 1582 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LGALS9C-212ENST00000583322 1602 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AKIRIN2-201ENST00000257787 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MORF4L1-201ENST00000331268 2359 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ICAM2-207ENST00000579687 1154 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SAE1-201ENST00000270225 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 BIRC2-206ENST00000530675 1927 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AC004982.2-201ENST00000609497 1578 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 HOXC4-201ENST00000303406 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MAP2K2-202ENST00000394867 1471 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CENPS-CORT-202ENST00000465026 494 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CENPS-CORT-203ENST00000470413 626 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ZNF302-214ENST00000613363 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 C16orf58-202ENST00000430477 2471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 RASSF1-202ENST00000357043 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 CYHR1-202ENST00000403000 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 FEZF1-202ENST00000427185 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 IFI6-203ENST00000362020 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
WDR53Q7Z5U6 AL360181.5-201ENST00000368554 1044 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms