Protein–RNA interactions for Protein: O14522

PTPRT, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, humanhuman

Predictions only

Length 1,441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRTO14522 AL591623.2-201ENST00000449978 222 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SEPT7P3-201ENST00000455017 621 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC010307.1-201ENST00000467206 836 ntBASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 TMEM161B-AS1-208ENST00000507736 630 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC013762.1-201ENST00000531136 467 ntTSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC093227.3-202ENST00000586606 704 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL360267.1-201ENST00000607309 666 ntTSL 4 BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 GALNT3-202ENST00000409882 2107 ntTSL 1 (best) BASIC4.76□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ING3-205ENST00000445699 1723 ntTSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 HNRNPC-203ENST00000430246 4501 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 LZTFL1-216ENST00000539217 4113 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 OR5BR1P-201ENST00000524992 1330 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC021086.1-201ENST00000499025 1569 ntTSL 3 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 TRGV5P-201ENST00000419915 354 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 UTS2B-203ENST00000427544 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC008264.1-201ENST00000447612 367 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AP000873.2-206ENST00000529811 429 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SARNP-203ENST00000552080 726 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC079203.2-201ENST00000559867 387 ntTSL 2 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 MSMB-202ENST00000582163 488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL451049.1-201ENST00000608672 497 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC231759.1-201ENST00000616455 597 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 UBE2E2-207ENST00000628311 267 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AF117829.1-206ENST00000621883 3802 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 PHF20L1-210ENST00000395390 5900 ntTSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 PROS2P-201ENST00000474651 1951 ntBASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 PPIG-207ENST00000448752 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 DMD-229ENST00000619831 13734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.75□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL132656.2-201ENST00000482985 1837 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RSL24D1P4-201ENST00000400938 484 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 HMGB3P18-201ENST00000406327 590 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC090952.1-201ENST00000424242 446 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RPL23AP82-202ENST00000427528 469 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC008278.2-201ENST00000438178 409 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC105272.1-201ENST00000438604 198 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL109933.2-201ENST00000452651 260 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 snoU13.26-201ENST00000459452 105 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 CENPBD1P1-201ENST00000464061 469 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RPS17P11-201ENST00000474297 293 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AP000859.1-201ENST00000525536 307 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ALKBH3-AS1-202ENST00000527960 547 ntTSL 4 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SNHG1-219ENST00000542112 780 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL512310.1-201ENST00000548639 172 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC009320.1-201ENST00000549070 349 ntTSL 3 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 MIR4425-201ENST00000580572 84 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 DGKI-204ENST00000453654 12928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ACTR6-212ENST00000552376 1659 ntTSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC017071.1-201ENST00000564407 2204 ntBASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ANO3-202ENST00000525139 3257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 TDRD15-201ENST00000405799 6135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC4.74□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 IL21-201ENST00000264497 629 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 RNU6-249P-201ENST00000363016 102 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL513477.1-202ENST00000417061 214 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC012065.2-201ENST00000421295 375 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC108938.1-201ENST00000451204 136 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 BCL2L15-204ENST00000471267 267 ntTSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 LINC02283-201ENST00000511634 474 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 C8orf22-203ENST00000517663 788 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 GS1-279B7.1-203ENST00000565520 609 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ATP5F1P7-201ENST00000567330 760 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC099793.1-201ENST00000567538 285 ntTSL 3 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 MIR4738-201ENST00000579134 87 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 MIR663AHG-231ENST00000609044 590 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL157817.1-201ENST00000614264 790 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SNHG5-221ENST00000624295 632 ntTSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC244205.2-202ENST00000635781 342 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 OXR1-205ENST00000442977 2956 ntTSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ANKRD30A-204ENST00000602533 4458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC006504.1-201ENST00000562493 3666 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 C6orf10-205ENST00000527965 2076 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 CAST-207ENST00000395813 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ASNSP3-201ENST00000451989 1306 ntBASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SLITRK6-201ENST00000400286 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ANKRD30A-202ENST00000374660 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 BRCA2-201ENST00000380152 11986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC4.73□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ANGPTL1-201ENST00000234816 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL445213.1-201ENST00000412589 747 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC006007.1-201ENST00000422084 672 ntTSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ISCA1P6-201ENST00000427740 390 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC020743.3-201ENST00000440351 360 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL135938.1-201ENST00000443141 297 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 VN1R48P-201ENST00000448149 1036 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 HMGN2P7-201ENST00000456186 273 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC112229.2-201ENST00000456683 476 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 SNORA70.19-201ENST00000516717 90 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 NRG1-IT1-201ENST00000520444 758 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC006518.1-201ENST00000541449 943 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL355922.5-201ENST00000553534 351 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 C18orf54-203ENST00000578138 776 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AP001180.2-201ENST00000579413 422 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AP005264.4-201ENST00000592203 422 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AC016747.2-202ENST00000607743 332 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 LINC00836-203ENST00000628620 1179 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 ATM-230ENST00000640388 578 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 MTCO1P8-201ENST00000416914 1523 ntBASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 PRKAA2-202ENST00000610361 9280 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 PLCB4-203ENST00000378493 5796 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 AL357832.1-201ENST00000427460 420 ntTSL 3 BASIC4.72□□□□□ -1.65
PTPRTO14522 Z83839.2-201ENST00000436294 274 ntTSL 5 BASIC4.72□□□□□ -1.65
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