Protein–RNA interactions for Protein: A6NKF2

ARID3C, AT-rich interactive domain-containing protein 3C, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 GPRIN2-202ENST00000374317 1966 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AKIP1-207ENST00000529876 1421 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ME3-202ENST00000393324 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ATP5G2P1-201ENST00000433580 426 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC30.25■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 SOCS2-207ENST00000549206 2072 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 OAF-201ENST00000328965 2525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 IMPDH1-208ENST00000470772 1888 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 TMEM206-205ENST00000535273 2119 ntTSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.23■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 DNAJB5-201ENST00000312316 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 PQLC2-202ENST00000375155 1805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 NME1-207ENST00000480143 964 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 SKP2-204ENST00000508514 821 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 TRMT112-203ENST00000535750 823 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 LINC00482-201ENST00000332012 2023 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 INTS11-202ENST00000411962 1832 ntTSL 5 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 FAM57B-204ENST00000564806 1710 ntTSL 2 BASIC30.22■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 MPG-203ENST00000397817 1039 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 PLAC8-202ENST00000411416 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 PCMT1-205ENST00000464889 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.21■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 KCNN4-201ENST00000262888 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 EPS8L1-203ENST00000540810 2360 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.43
ARID3CA6NKF2 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 MGAT4B-201ENST00000292591 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 TXNRD3-204ENST00000640433 1932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AP001271.2-201ENST00000624018 1556 ntBASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ADM-206ENST00000528655 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 AVPR2-202ENST00000358927 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC30.18■■■□□ 2.42
ARID3CA6NKF2 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms