Protein–RNA interactions for Protein: P53992

SEC24C, Protein transport protein Sec24C, humanhuman

Predictions only

Length 1,094 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC24CP53992 KLF1-201ENST00000264834 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ESX1-201ENST00000372588 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 LTC4S-202ENST00000401985 486 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 NKX2-5-202ENST00000424406 1124 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CHTF8-210ENST00000523421 766 ntTSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 DTX2-206ENST00000430490 2623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MRPL2-202ENST00000388752 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MARK2-207ENST00000502399 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PYCARD-202ENST00000350605 696 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AL136116.3-201ENST00000402907 1138 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 STK16-201ENST00000396738 1673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 HPGD-213ENST00000541923 2920 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AC091799.1-201ENST00000422823 811 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AC007322.3-201ENST00000426526 701 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 CLN3-205ENST00000359984 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PLEKHG2-202ENST00000409797 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 UBE2C-201ENST00000243893 476 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 DESI2-201ENST00000263831 859 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 MAST4-205ENST00000406039 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 AC120498.10-201ENST00000621827 505 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 SBF2-AS1-201ENST00000498905 2709 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 HSPA8-202ENST00000453788 2004 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ACTL6B-201ENST00000160382 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 ADA-201ENST00000372874 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SEC24CP53992 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC24CP53992 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SEC24CP53992 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms