Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 NDRG2-242ENST00000555158 2216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 WASH6P-203ENST00000460206 1826 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RFXANK-201ENST00000303088 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 MFSD10-206ENST00000508221 1639 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ACTR5-201ENST00000243903 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 MFF-205ENST00000354503 1085 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ZNF467-202ENST00000484747 913 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AC099522.1-201ENST00000505955 881 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AC092143.2-201ENST00000554623 985 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RBM42-204ENST00000589559 1328 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 TIGD6-202ENST00000515406 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 KRT8-217ENST00000619952 2437 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SERPINB6-204ENST00000380529 1370 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 GNA15-201ENST00000262958 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 MFSD10-201ENST00000329687 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ATF5-202ENST00000595125 1637 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 IKZF1-209ENST00000438033 1748 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ARHGDIA-201ENST00000269321 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RRN3P1Q2M238 AL390719.1-204ENST00000412397 1219 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RRN3P1Q2M238 AL049874.3-201ENST00000557618 868 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PCDHAC2-203ENST00000615316 3011 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RIPPLY3-201ENST00000329553 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 DET1-207ENST00000564406 2315 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RRN3P1Q2M238 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RNH1-206ENST00000438658 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ACBD4-201ENST00000321854 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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RRN3P1Q2M238 SPON2-201ENST00000290902 1869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 REM2-201ENST00000267396 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SLC16A3-201ENST00000392339 2074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SLC16A3-202ENST00000392341 2086 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PSPN-201ENST00000245810 471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PHB2-201ENST00000399433 1308 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 MFSD10-211ENST00000514800 1776 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 OTUB1-210ENST00000541478 1803 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 ACHE-207ENST00000428317 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 FSTL3-201ENST00000166139 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 EIF2AK3-201ENST00000303236 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 CBFA2T2-201ENST00000342704 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 GRB14-201ENST00000263915 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
RRN3P1Q2M238 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
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