Protein–RNA interactions for Protein: Q16394

EXT1, Exostosin-1, humanhuman

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Length 746 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXT1Q16394 MUC1-211ENST00000438413 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 APTR-204ENST00000440088 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 PSMD8-201ENST00000215071 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 UBXN11-201ENST00000314675 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 FDXR-201ENST00000293195 1875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CCM2-202ENST00000381112 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 HOXD12-202ENST00000406506 1318 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 DMPK-205ENST00000458663 2548 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 MESTP1-201ENST00000404287 994 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TCF3P1-201ENST00000423021 1937 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 NF2-201ENST00000334961 2020 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ZNF773-204ENST00000598770 2019 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 IL15-208ENST00000529613 1355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 PLCD1-201ENST00000334661 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 LINC01521-201ENST00000504184 1943 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC092835.1-201ENST00000425953 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AZIN1-AS1-215ENST00000522939 644 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 AC097493.4-201ENST00000641197 219 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
EXT1Q16394 C19orf35-201ENST00000342063 2574 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SEMA6B-202ENST00000586965 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 WNT10B-202ENST00000403957 1817 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
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EXT1Q16394 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
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EXT1Q16394 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
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EXT1Q16394 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 WIPF1-203ENST00000392546 2180 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
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EXT1Q16394 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 GLRB-205ENST00000512619 728 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 SLC38A11-203ENST00000409149 1621 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
EXT1Q16394 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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