Protein–RNA interactions for Protein: Q9R1P0

Psma4, Proteasome subunit alpha type-4, mousemouse

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psma4Q9R1P0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Psma4Q9R1P0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Psma4Q9R1P0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Psma4Q9R1P0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Psma4Q9R1P0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Psma4Q9R1P0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms