Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2H8

Fndc8, Fibronectin type III domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc8Q9D2H8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Fndc8Q9D2H8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Fndc8Q9D2H8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Fndc8Q9D2H8 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fndc8Q9D2H8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms