Protein–RNA interactions for Protein: Q5BKP2

Usp13, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 13, mousemouse

Predictions only

Length 858 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp13Q5BKP2 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Usp13Q5BKP2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Usp13Q5BKP2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Usp13Q5BKP2 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Usp13Q5BKP2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Usp13Q5BKP2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Usp13Q5BKP2 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Usp13Q5BKP2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms