Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1N9

A3galt2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3galt2Q3V1N9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC19.41■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.4■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
A3galt2Q3V1N9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
A3galt2Q3V1N9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
A3galt2Q3V1N9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
A3galt2Q3V1N9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3galt2Q3V1N9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
A3galt2Q3V1N9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3galt2Q3V1N9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3galt2Q3V1N9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3galt2Q3V1N9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
A3galt2Q3V1N9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms