Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV5

Skap1, Src kinase-associated phosphoprotein 1, mousemouse

Predictions only

Length 355 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skap1Q3UUV5 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Skap1Q3UUV5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.83■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.81■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Skap1Q3UUV5 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Skap1Q3UUV5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Skap1Q3UUV5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Skap1Q3UUV5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Skap1Q3UUV5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Skap1Q3UUV5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 134.2 ms