Protein–RNA interactions for Protein: Q12408

NPC2, Phosphatidylglycerol/phosphatidylinositol transfer protein, yeastyeast

Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NPC2Q12408 YCP4YCR004C 744 nt7.42□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 YMR147WYMR147W 672 nt7.41□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 IDP3YNL009W 1263 nt7.41□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 SCO2YBR024W 906 nt7.41□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 YMC2YBR104W 990 nt7.41□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 SAM50YNL026W 1455 nt7.41□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 ATG22YCL038C 1587 nt7.41□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 HTS1YPR033C 1641 nt7.41□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 TMS1YDR105C 1422 nt7.4□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 ALD5YER073W 1563 nt7.4□□□□□ -1.22
NPC2Q12408 FET5YFL041W 1869 nt7.4□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 YGR210CYGR210C 1236 nt7.39□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 MTO1YGL236C 2010 nt7.39□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 NBA1YOL070C 1506 nt7.38□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 MCM5YLR274W 2328 nt7.38□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 AAT1YKL106W 1356 nt7.38□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 YDR509WYDR509W 348 nt7.38□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 MRS4YKR052C 915 nt7.38□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.37□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.37□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.37□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.37□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.37□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 PIC2YER053C 903 nt7.37□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 YGL118CYGL118C 438 nt7.36□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 YIR035CYIR035C 765 nt7.35□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 URE2YNL229C 1065 nt7.35□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 YPL108WYPL108W 507 nt7.35□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 PZF1YPR186C 1290 nt7.35□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 TPN1YGL186C 1740 nt7.35□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 YLR072WYLR072W 2082 nt7.34□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 RNA170RNA170 169 nt7.34□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 MET22YOL064C 1074 nt7.34□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 YOR072WYOR072W 315 nt7.34□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 NAT5YOR253W 531 nt7.34□□□□□ -1.23
NPC2Q12408 TRP2YER090W 1524 nt7.33□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YBR056WYBR056W 1506 nt7.33□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 ICE2YIL090W 1476 nt7.33□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 snR86snR86 1004 nt7.33□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YMR166CYMR166C 1107 nt7.33□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YBL081WYBL081W 1107 nt7.33□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 THI6YPL214C 1623 nt7.33□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 MOD5YOR274W 1287 nt7.32□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 HXT11YOL156W 1704 nt7.32□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YEL074WYEL074W 339 nt7.31□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YLR460CYLR460C 1131 nt7.31□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YIL177CYIL177C 5277 nt7.31□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 NPP1YCR026C 2229 nt7.31□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 OCH1YGL038C 1443 nt7.3□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 CHS7YHR142W 951 nt7.3□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YJR149WYJR149W 1215 nt7.3□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 BUB2YMR055C 921 nt7.3□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 PDC6YGR087C 1692 nt7.3□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 CAK1YFL029C 1107 nt7.29□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 EMC3YKL207W 762 nt7.29□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YMR007WYMR007W 381 nt7.29□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 FCY1YPR062W 477 nt7.29□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 GID7YCL039W 2238 nt7.28□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YJL009WYJL009W 327 nt7.28□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YJL160CYJL160C 864 nt7.28□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 AIM41YOR215C 558 nt7.28□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 LSP1YPL004C 1026 nt7.28□□□□□ -1.24
NPC2Q12408 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.27□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.27□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.27□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 YHP1YDR451C 1062 nt7.27□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 MEP1YGR121C 1479 nt7.27□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 SIR2YDL042C 1689 nt7.27□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 YCR099CYCR099C 468 nt7.26□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 SRM1YGL097W 1449 nt7.26□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 PET18YCR020C 648 nt7.25□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 GET2YER083C 858 nt7.25□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 YIA6YIL006W 1122 nt7.25□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 RRT14YIL127C 621 nt7.25□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 OLA1YBR025C 1185 nt7.25□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 LSM12YHR121W 564 nt7.24□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 MRS3YJL133W 945 nt7.24□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 BNA3YJL060W 1335 nt7.24□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 OCA1YNL099C 717 nt7.23□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 ABP1YCR088W 1779 nt7.23□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 URA8YJR103W 1737 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 RCR1YBR005W 642 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 LEA1YPL213W 717 nt7.22□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 YMR210WYMR210W 1350 nt7.21□□□□□ -1.25
NPC2Q12408 YER156CYER156C 1017 nt7.21□□□□□ -1.26
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.4 ms