Protein–RNA interactions for Protein: Q12078

SMF3, Iron transporter SMF3, yeastyeast

Predicted RBP Predictions only

Length 473 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMF3Q12078 FET5YFL041W 1869 nt8.04□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 THI6YPL214C 1623 nt8.03□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 YEL023CYEL023C 2049 nt8.03□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 CBK1YNL161W 2271 nt8.03□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 GGA2YHR108W 1758 nt8.03□□□□□ -1.12
SMF3Q12078 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt8.02□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 ECM27YJR106W 2178 nt8.02□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 NPP2YEL016C 1482 nt8.01□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 YDR467CYDR467C 327 nt8.01□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 GPM1YKL152C 744 nt8.01□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 TPN1YGL186C 1740 nt8□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 UFD1YGR048W 1086 nt8□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 YJL160CYJL160C 864 nt8□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 YMR166CYMR166C 1107 nt8□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 GCD11YER025W 1584 nt8□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 MAM3YOL060C 2121 nt7.99□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 LSP1YPL004C 1026 nt7.99□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 NAS6YGR232W 687 nt7.98□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 MGM101YJR144W 810 nt7.98□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 DUR3YHL016C 2208 nt7.98□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 FIT1YDR534C 1587 nt7.97□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 EMC3YKL207W 762 nt7.97□□□□□ -1.13
SMF3Q12078 YLR460CYLR460C 1131 nt7.96□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 MLS1YNL117W 1665 nt7.95□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 PET18YCR020C 648 nt7.95□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.95□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.95□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 ORT1YOR130C 879 nt7.95□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 YMR210WYMR210W 1350 nt7.95□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 CAK1YFL029C 1107 nt7.94□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 MET22YOL064C 1074 nt7.94□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 TRP2YER090W 1524 nt7.93□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 OCH1YGL038C 1443 nt7.93□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 CHS7YHR142W 951 nt7.92□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 BUD20YLR074C 501 nt7.92□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 YBL095WYBL095W 813 nt7.92□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 STF1YDL130W-A 261 nt7.91□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 GRH1YDR517W 1119 nt7.91□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 RRT14YIL127C 621 nt7.91□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 DUS3YLR401C 2007 nt7.9□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 PAU21YOR394W 495 nt7.9□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 PAU22YPL282C 495 nt7.9□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 snR4snR4 186 nt7.9□□□□□ -1.14
SMF3Q12078 RNA170RNA170 169 nt7.89□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 YMC2YBR104W 990 nt7.89□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 HXT11YOL156W 1704 nt7.89□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 PDC6YGR087C 1692 nt7.89□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 TMS1YDR105C 1422 nt7.88□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 OLA1YBR025C 1185 nt7.88□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 UTR5YEL035C 501 nt7.87□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 YIR035CYIR035C 765 nt7.87□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 YJR149WYJR149W 1215 nt7.87□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 MRS4YKR052C 915 nt7.86□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 YOR343CYOR343C 327 nt7.86□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 LPD1YFL018C 1500 nt7.86□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 ADE16YLR028C 1776 nt7.86□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 YER156CYER156C 1017 nt7.85□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 HRA1HRA1 564 nt7.85□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 MFT1YML062C 1179 nt7.84□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 BUB2YMR055C 921 nt7.84□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 RPS6AYPL090C 711 nt7.84□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 RPS6BYBR181C 711 nt7.84□□□□□ -1.15
SMF3Q12078 ADA2YDR448W 1305 nt7.83□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 BXI1YNL305C 894 nt7.83□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 SRM1YGL097W 1449 nt7.83□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 AAT1YKL106W 1356 nt7.83□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 MRP1YDR347W 966 nt7.82□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 YJL009WYJL009W 327 nt7.82□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 UBP13YBL067C 2244 nt7.81□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 RHO1YPR165W 630 nt7.81□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 YBR056WYBR056W 1506 nt7.8□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 GDH1YOR375C 1365 nt7.8□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 GUT1YHL032C 2130 nt7.79□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 YPR084WYPR084W 1371 nt7.79□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 YPT31YER031C 672 nt7.78□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 YAL016C-AYAL016C-A 315 nt7.78□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 MEP1YGR121C 1479 nt7.78□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 PAB1YER165W 1734 nt7.78□□□□□ -1.16
SMF3Q12078 YIL177CYIL177C 5277 nt7.77□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 ELP4YPL101W 1371 nt7.77□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 FTH1YBR207W 1398 nt7.77□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 snR86snR86 1004 nt7.77□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 PFS2YNL317W 1398 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 TAD2YJL035C 753 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 YMR206WYMR206W 942 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 THI73YLR004C 1572 nt7.76□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 SHC1YER096W 1539 nt7.75□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 ATP2YJR121W 1536 nt7.75□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 RPL12BYDR418W 498 nt7.75□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 DIA4YHR011W 1341 nt7.75□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 ECM10YEL030W 1935 nt7.74□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 PUP3YER094C 618 nt7.74□□□□□ -1.17
SMF3Q12078 ALR1YOL130W 2580 nt7.73□□□□□ -1.17
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