Protein–RNA interactions for Protein: Q08438

VHS3, Phosphopantothenoylcysteine decarboxylase subunit VHS3, yeastyeast

Predictions only

Length 674 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS3Q08438 YLR460CYLR460C 1131 nt8.21□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 PHB2YGR231C 933 nt8.2□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 ADH3YMR083W 1128 nt8.2□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 BUD31YCR063W 474 nt8.19□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 STP3YLR375W 1032 nt8.19□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 GLY1YEL046C 1164 nt8.18□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 ALR1YOL130W 2580 nt8.18□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 PFS2YNL317W 1398 nt8.18□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 TGL5YOR081C 2250 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 PAU5YFL020C 369 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 INM1YHR046C 888 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 MOB1YIL106W 945 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 TDA4YJR116W 840 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 MDH2YOL126C 1134 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 YPL041CYPL041C 624 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 INO1YJL153C 1602 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 RTG2YGL252C 1767 nt8.17□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 ADH7YCR105W 1086 nt8.16□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 YLR173WYLR173W 1827 nt8.15□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 CHS7YHR142W 951 nt8.15□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 OLA1YBR025C 1185 nt8.15□□□□□ -1.1
VHS3Q08438 MRN1YPL184C 1839 nt8.13□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 EHT1YBR177C 1356 nt8.12□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 SLM3YDL033C 1254 nt8.12□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 COG1YGL223C 1254 nt8.12□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 PAU15YIR041W 375 nt8.12□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 YGR137WYGR137W 375 nt8.11□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 FLX1YIL134W 936 nt8.11□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 CYC3YAL039C 810 nt8.11□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 PGC1YPL206C 966 nt8.11□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 HSV2YGR223C 1347 nt8.1□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 SRP102YKL154W 735 nt8.1□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 CBK1YNL161W 2271 nt8.1□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 WSC3YOL105C 1671 nt8.09□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 LCP5YER127W 1074 nt8.09□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 RCF1YML030W 480 nt8.09□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 MET22YOL064C 1074 nt8.09□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 LRO1YNR008W 1986 nt8.09□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 MET30YIL046W 1923 nt8.09□□□□□ -1.11
VHS3Q08438 MLS1YNL117W 1665 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 DIP5YPL265W 1827 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)DtA(AGC)D 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)FtA(AGC)F 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)GtA(AGC)G 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)HtA(AGC)H 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)JtA(AGC)J 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)K1tA(AGC)K1 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)K2tA(AGC)K2 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)LtA(AGC)L 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)M1tA(AGC)M1 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)M2tA(AGC)M2 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tA(AGC)PtA(AGC)P 73 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 YLR280CYLR280C 351 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 RNA170RNA170 169 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 KTR4YBR199W 1395 nt8.08□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 RPL2AYFR031C-A 765 nt8.07□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 IPL1YPL209C 1104 nt8.07□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 PMT7YDR307W 1989 nt8.06□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 YEL034C-AYEL034C-A 603 nt8.06□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 YNL190WYNL190W 615 nt8.06□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 YBR232CYBR232C 360 nt8.06□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 URH1YDR400W 1023 nt8.05□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 MRP7YNL005C 1116 nt8.05□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 PDC6YGR087C 1692 nt8.05□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 tS(GCU)LtS(GCU)L 80 nt8.04□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 RAD51YER095W 1203 nt8.03□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 WSC4YHL028W 1818 nt8.03□□□□□ -1.12
VHS3Q08438 ERO1YML130C 1692 nt8.02□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 MGM101YJR144W 810 nt8.02□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 OCH1YGL038C 1443 nt8.02□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 GCD11YER025W 1584 nt8.01□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 YHR131CYHR131C 2553 nt8□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 MET13YGL125W 1803 nt7.99□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 ARO3YDR035W 1113 nt7.99□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 PUP3YER094C 618 nt7.99□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 YMR166CYMR166C 1107 nt7.99□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 YTH1YPR107C 627 nt7.99□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 RHO1YPR165W 630 nt7.99□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 ALG7YBR243C 1347 nt7.98□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 CAK1YFL029C 1107 nt7.97□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.97□□□□□ -1.13
VHS3Q08438 YCR025CYCR025C 411 nt7.96□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 YPL264CYPL264C 1062 nt7.95□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 THI73YLR004C 1572 nt7.95□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 RSC9YML127W 1746 nt7.95□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.94□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 RRT6YGL146C 936 nt7.94□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 FAF1YIL019W 1041 nt7.94□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 RRT14YIL127C 621 nt7.94□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 LAS17YOR181W 1902 nt7.93□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 YPT31YER031C 672 nt7.93□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 SER2YGR208W 930 nt7.93□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 YLR122CYLR122C 378 nt7.93□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 SGF73YGL066W 1974 nt7.93□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 HTS1YPR033C 1641 nt7.92□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 YGR210CYGR210C 1236 nt7.92□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 HXT8YJL214W 1710 nt7.92□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 ECM10YEL030W 1935 nt7.91□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 CKB1YGL019W 837 nt7.91□□□□□ -1.14
VHS3Q08438 SNP1YIL061C 903 nt7.91□□□□□ -1.14
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