Protein–RNA interactions for Protein: Q06318

Scgb1a1, Uteroglobin, mousemouse

Predictions only

Length 96 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scgb1a1Q06318 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Scgb1a1Q06318 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Scgb1a1Q06318 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Scgb1a1Q06318 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Scgb1a1Q06318 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scgb1a1Q06318 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scgb1a1Q06318 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Scgb1a1Q06318 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Scgb1a1Q06318 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Scgb1a1Q06318 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Scgb1a1Q06318 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms