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Protein–RNA interactions for Protein: Q04053
SNX41, Sorting nexin-41, yeast
Predictions only
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625 aa
.
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Protein
RNA
Prediction (catRAPID)
Interaction (RIP-Chip)
Gene
UniProt Accession
Gene
Ensembl Transcript ID
Length
Transcript Status
Prediction Score
Prediction z-Score
Detected Interaction
SNX41
Q04053
YCP4
YCR004C
744 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
tE(CUC)D
tE(CUC)D
72 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
tE(CUC)I
tE(CUC)I
72 nt
7.45
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
NDE1
YMR145C
1683 nt
7.44
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
CHA1
YCL064C
1083 nt
7.44
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
LYS20
YDL182W
1287 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
SER2
YGR208W
930 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
GPM1
YKL152C
744 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
SRP102
YKL154W
735 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
GAS1
YMR307W
1680 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
SAM50
YNL026W
1455 nt
7.43
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
SWM1
YDR260C
513 nt
7.42
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
YFR020W
YFR020W
699 nt
7.42
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
GGA2
YHR108W
1758 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
YMR316C-B
YMR316C-B
309 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
PTC6
YCR079W
1329 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
ITR1
YDR497C
1755 nt
7.41
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
YLR280C
YLR280C
351 nt
7.4
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
MDH2
YOL126C
1134 nt
7.4
□□□□□ -1.22
SNX41
Q04053
THI3
YDL080C
1830 nt
7.4
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
GGC1
YDL198C
903 nt
7.39
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
EMC3
YKL207W
762 nt
7.39
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
YBL095W
YBL095W
813 nt
7.39
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
ERO1
YML130C
1692 nt
7.38
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
HTS1
YPR033C
1641 nt
7.38
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
SLM3
YDL033C
1254 nt
7.38
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
TOP3
YLR234W
1971 nt
7.38
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
PRC1
YMR297W
1599 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
GNP1
YDR508C
1992 nt
7.37
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
DIA4
YHR011W
1341 nt
7.36
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
YGR210C
YGR210C
1236 nt
7.36
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
YMC2
YBR104W
990 nt
7.36
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
CTF3
YLR381W
2202 nt
7.36
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
BEM1
YBR200W
1656 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
RSM7
YJR113C
744 nt
7.35
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
CCR4
YAL021C
2514 nt
7.34
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
YIA6
YIL006W
1122 nt
7.34
□□□□□ -1.23
SNX41
Q04053
AFG2
YLR397C
2343 nt
7.33
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
AAT1
YKL106W
1356 nt
7.33
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
PMT7
YDR307W
1989 nt
7.32
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
YMR007W
YMR007W
381 nt
7.32
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
YMR210W
YMR210W
1350 nt
7.32
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
MRS4
YKR052C
915 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
ATP10
YLR393W
840 nt
7.31
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
TGA1
tA(UGC)A
73 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
tA(UGC)E
tA(UGC)E
73 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
tA(UGC)G
tA(UGC)G
73 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
tA(UGC)L
tA(UGC)L
73 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
tA(UGC)O
tA(UGC)O
73 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
RIB1
YBL033C
1038 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
YPL108W
YPL108W
507 nt
7.3
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
SPE4
YLR146C
903 nt
7.29
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
AAC3
YBR085W
924 nt
7.29
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
YLR072W
YLR072W
2082 nt
7.29
□□□□□ -1.24
SNX41
Q04053
SOD2
YHR008C
702 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YLR460C
YLR460C
1131 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
ERG6
YML008C
1152 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YMR166C
YMR166C
1107 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YMR253C
YMR253C
1245 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
RCR1
YBR005W
642 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YPL264C
YPL264C
1062 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YIL108W
YIL108W
2091 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
TMS1
YDR105C
1422 nt
7.26
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YIR035C
YIR035C
765 nt
7.25
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
ATO2
YNR002C
849 nt
7.25
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
MET22
YOL064C
1074 nt
7.25
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
FCY1
YPR062W
477 nt
7.25
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YJL009W
YJL009W
327 nt
7.24
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
ERR3
YMR323W
1314 nt
7.24
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
ERR1
YOR393W
1314 nt
7.24
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
ERR2
YPL281C
1314 nt
7.24
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
CHS7
YHR142W
951 nt
7.23
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YJL160C
YJL160C
864 nt
7.23
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
RNA170
RNA170
169 nt
7.23
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
LSP1
YPL004C
1026 nt
7.23
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
OCH1
YGL038C
1443 nt
7.22
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
CAK1
YFL029C
1107 nt
7.22
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
RRT14
YIL127C
621 nt
7.22
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
YJR149W
YJR149W
1215 nt
7.22
□□□□□ -1.25
SNX41
Q04053
snR86
snR86
1004 nt
7.21
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
LEA1
YPL213W
717 nt
7.21
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
PDC6
YGR087C
1692 nt
7.21
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
MAS2
YHR024C
1449 nt
7.2
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
BUB2
YMR055C
921 nt
7.2
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
YDR306C
YDR306C
1437 nt
7.19
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
OLA1
YBR025C
1185 nt
7.19
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
YBR056W
YBR056W
1506 nt
7.18
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
YER152C
YER152C
1332 nt
7.18
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
YEL023C
YEL023C
2049 nt
7.17
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
HXT13
YEL069C
1695 nt
7.17
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
HXT9
YJL219W
1704 nt
7.17
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
ABP1
YCR088W
1779 nt
7.16
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
PET18
YCR020C
648 nt
7.16
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
YER152W-A
YER152W-A
567 nt
7.16
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
AQR1
YNL065W
1761 nt
7.15
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
MSB3
YNL293W
1902 nt
7.15
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
YER156C
YER156C
1017 nt
7.15
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
YNL040W
YNL040W
1371 nt
7.15
□□□□□ -1.26
SNX41
Q04053
GUT1
YHL032C
2130 nt
7.15
□□□□□ -1.27
SNX41
Q04053
STF1
YDL130W-A
261 nt
7.14
□□□□□ -1.27
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