Protein–RNA interactions for Protein: Q04053

SNX41, Sorting nexin-41, yeastyeast

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SNX41Q04053 YCP4YCR004C 744 nt7.45□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 tE(CUC)DtE(CUC)D 72 nt7.45□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 tE(CUC)ItE(CUC)I 72 nt7.45□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 NDE1YMR145C 1683 nt7.44□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 CHA1YCL064C 1083 nt7.44□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 LYS20YDL182W 1287 nt7.43□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 SER2YGR208W 930 nt7.43□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 GPM1YKL152C 744 nt7.43□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 SRP102YKL154W 735 nt7.43□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 GAS1YMR307W 1680 nt7.43□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 SAM50YNL026W 1455 nt7.43□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 SWM1YDR260C 513 nt7.42□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 YFR020WYFR020W 699 nt7.42□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 GGA2YHR108W 1758 nt7.41□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 YMR316C-BYMR316C-B 309 nt7.41□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 PTC6YCR079W 1329 nt7.41□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 ITR1YDR497C 1755 nt7.41□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 YLR280CYLR280C 351 nt7.4□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 MDH2YOL126C 1134 nt7.4□□□□□ -1.22
SNX41Q04053 THI3YDL080C 1830 nt7.4□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 GGC1YDL198C 903 nt7.39□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 EMC3YKL207W 762 nt7.39□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 YBL095WYBL095W 813 nt7.39□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 ERO1YML130C 1692 nt7.38□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 HTS1YPR033C 1641 nt7.38□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 SLM3YDL033C 1254 nt7.38□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 TOP3YLR234W 1971 nt7.38□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 PRC1YMR297W 1599 nt7.37□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 GNP1YDR508C 1992 nt7.37□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 DIA4YHR011W 1341 nt7.36□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 YGR210CYGR210C 1236 nt7.36□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 YMC2YBR104W 990 nt7.36□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 CTF3YLR381W 2202 nt7.36□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 BEM1YBR200W 1656 nt7.35□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 RSM7YJR113C 744 nt7.35□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 CCR4YAL021C 2514 nt7.34□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 YIA6YIL006W 1122 nt7.34□□□□□ -1.23
SNX41Q04053 AFG2YLR397C 2343 nt7.33□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 AAT1YKL106W 1356 nt7.33□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 PMT7YDR307W 1989 nt7.32□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 YMR007WYMR007W 381 nt7.32□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 YMR210WYMR210W 1350 nt7.32□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 MRS4YKR052C 915 nt7.31□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 ATP10YLR393W 840 nt7.31□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.3□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 RIB1YBL033C 1038 nt7.3□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 YPL108WYPL108W 507 nt7.3□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 SPE4YLR146C 903 nt7.29□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 AAC3YBR085W 924 nt7.29□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 YLR072WYLR072W 2082 nt7.29□□□□□ -1.24
SNX41Q04053 SOD2YHR008C 702 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YLR460CYLR460C 1131 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 ERG6YML008C 1152 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YMR166CYMR166C 1107 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YMR253CYMR253C 1245 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 RCR1YBR005W 642 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YPL264CYPL264C 1062 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YIL108WYIL108W 2091 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 TMS1YDR105C 1422 nt7.26□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YIR035CYIR035C 765 nt7.25□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 ATO2YNR002C 849 nt7.25□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 MET22YOL064C 1074 nt7.25□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 FCY1YPR062W 477 nt7.25□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YJL009WYJL009W 327 nt7.24□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 ERR3YMR323W 1314 nt7.24□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 ERR1YOR393W 1314 nt7.24□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 ERR2YPL281C 1314 nt7.24□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 CHS7YHR142W 951 nt7.23□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YJL160CYJL160C 864 nt7.23□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 RNA170RNA170 169 nt7.23□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 LSP1YPL004C 1026 nt7.23□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 OCH1YGL038C 1443 nt7.22□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 CAK1YFL029C 1107 nt7.22□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 RRT14YIL127C 621 nt7.22□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 YJR149WYJR149W 1215 nt7.22□□□□□ -1.25
SNX41Q04053 snR86snR86 1004 nt7.21□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 LEA1YPL213W 717 nt7.21□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 PDC6YGR087C 1692 nt7.21□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 MAS2YHR024C 1449 nt7.2□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 BUB2YMR055C 921 nt7.2□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 YDR306CYDR306C 1437 nt7.19□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 OLA1YBR025C 1185 nt7.19□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 YBR056WYBR056W 1506 nt7.18□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 YER152CYER152C 1332 nt7.18□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 YEL023CYEL023C 2049 nt7.17□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 HXT13YEL069C 1695 nt7.17□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 HXT9YJL219W 1704 nt7.17□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 ABP1YCR088W 1779 nt7.16□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 PET18YCR020C 648 nt7.16□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 YER152W-AYER152W-A 567 nt7.16□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 AQR1YNL065W 1761 nt7.15□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 MSB3YNL293W 1902 nt7.15□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 YER156CYER156C 1017 nt7.15□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 YNL040WYNL040W 1371 nt7.15□□□□□ -1.26
SNX41Q04053 GUT1YHL032C 2130 nt7.15□□□□□ -1.27
SNX41Q04053 STF1YDL130W-A 261 nt7.14□□□□□ -1.27
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