Protein–RNA interactions for Protein: Q03785

VHS1, Serine/threonine-protein kinase VHS1, yeastyeast

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
VHS1Q03785 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 YGR210CYGR210C 1236 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 FCY1YPR062W 477 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 FIT1YDR534C 1587 nt7.88□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 GRH1YDR517W 1119 nt7.87□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 YJL009WYJL009W 327 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 YJR149WYJR149W 1215 nt7.86□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 HBS1YKR084C 1836 nt7.85□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 MFG1YDL233W 1377 nt7.84□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 AAC3YBR085W 924 nt7.84□□□□□ -1.15
VHS1Q03785 EMC3YKL207W 762 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 OLA1YBR025C 1185 nt7.83□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 TMS1YDR105C 1422 nt7.82□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 CHS7YHR142W 951 nt7.82□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 YIR035CYIR035C 765 nt7.82□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 EDC2YER035W 438 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 LSP1YPL004C 1026 nt7.81□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 TRP2YER090W 1524 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 MRP1YDR347W 966 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 BUB2YMR055C 921 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 MET22YOL064C 1074 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 YPL108WYPL108W 507 nt7.78□□□□□ -1.16
VHS1Q03785 FET5YFL041W 1869 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 YIL177CYIL177C 5277 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 YJL160CYJL160C 864 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 YMR166CYMR166C 1107 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 NSG2YNL156C 900 nt7.77□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 snR86snR86 1004 nt7.76□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 THI6YPL214C 1623 nt7.76□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 MEP1YGR121C 1479 nt7.75□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 CAK1YFL029C 1107 nt7.75□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 ORT1YOR130C 879 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 OCH1YGL038C 1443 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 MET30YIL046W 1923 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 DUR3YHL016C 2208 nt7.74□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 TOS1YBR162C 1368 nt7.73□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 YNL190WYNL190W 615 nt7.73□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 HOG1YLR113W 1308 nt7.73□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 RRT14YIL127C 621 nt7.72□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 YMR210WYMR210W 1350 nt7.71□□□□□ -1.17
VHS1Q03785 YMR206WYMR206W 942 nt7.71□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 YBR056WYBR056W 1506 nt7.71□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 PDC6YGR087C 1692 nt7.7□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 YPT31YER031C 672 nt7.7□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 RNA170RNA170 169 nt7.7□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 RTG2YGL252C 1767 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 RHO1YPR165W 630 nt7.69□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 LAS17YOR181W 1902 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 THI73YLR004C 1572 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 tL(UAA)B1tL(UAA)B1 84 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 tL(UAA)B2tL(UAA)B2 84 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 tL(UAA)DtL(UAA)D 84 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 SUP51tL(UAA)J 84 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 tL(UAA)KtL(UAA)K 84 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 tL(UAA)LtL(UAA)L 84 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 tL(UAA)NtL(UAA)N 84 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 snR4snR4 186 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 HXT11YOL156W 1704 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 ADE16YLR028C 1776 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 GDH1YOR375C 1365 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 DUS3YLR401C 2007 nt7.68□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 YLR173WYLR173W 1827 nt7.67□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 ADE5,7YGL234W 2409 nt7.65□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 INO1YJL153C 1602 nt7.65□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 KAE1YKR038C 1161 nt7.65□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 LEA1YPL213W 717 nt7.65□□□□□ -1.18
VHS1Q03785 NDE2YDL085W 1638 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 YPR084WYPR084W 1371 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 ADA2YDR448W 1305 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 PET18YCR020C 648 nt7.64□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 GCD11YER025W 1584 nt7.63□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 HIS3YOR202W 663 nt7.63□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 SRM1YGL097W 1449 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 EHT1YBR177C 1356 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 MFT1YML062C 1179 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 YLR072WYLR072W 2082 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 YRF1-1YDR545W 5391 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 YRF1-5YLR467W 5391 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 YRF1-8YOR396W 5391 nt7.62□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 RPS6AYPL090C 711 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 RPS6BYBR181C 711 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 RSC4YKR008W 1878 nt7.61□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 ECM10YEL030W 1935 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 PUP3YER094C 618 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 YGR137WYGR137W 375 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 TAD2YJL035C 753 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 BXI1YNL305C 894 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 LRO1YNR008W 1986 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 PMA2YPL036W 2844 nt7.6□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 ABP1YCR088W 1779 nt7.59□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 YHL030W-AYHL030W-A 462 nt7.59□□□□□ -1.19
VHS1Q03785 SHC1YER096W 1539 nt7.58□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 BAP3YDR046C 1815 nt7.58□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 FRT1YOR324C 1809 nt7.57□□□□□ -1.2
VHS1Q03785 BUD31YCR063W 474 nt7.57□□□□□ -1.2
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 21.5 ms