Protein–RNA interactions for Protein: P43407

Sdc2, Syndecan-2, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sdc2P43407 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Sdc2P43407 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Sdc2P43407 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Sdc2P43407 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Sdc2P43407 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Sdc2P43407 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Sdc2P43407 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.3 ms