Protein–RNA interactions for Protein: P41808

SMK1, Sporulation-specific mitogen-activated protein kinase SMK1, yeastyeast

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
SMK1P41808 AAT1YKL106W 1356 nt7.46□□□□□ -1.21
SMK1P41808 HTS1YPR033C 1641 nt7.46□□□□□ -1.21
SMK1P41808 RTG2YGL252C 1767 nt7.46□□□□□ -1.22
SMK1P41808 TMS1YDR105C 1422 nt7.45□□□□□ -1.22
SMK1P41808 SAM50YNL026W 1455 nt7.44□□□□□ -1.22
SMK1P41808 NBA1YOL070C 1506 nt7.44□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YCP4YCR004C 744 nt7.44□□□□□ -1.22
SMK1P41808 LCP5YER127W 1074 nt7.44□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YGR210CYGR210C 1236 nt7.44□□□□□ -1.22
SMK1P41808 TGA1tA(UGC)A 73 nt7.43□□□□□ -1.22
SMK1P41808 tA(UGC)EtA(UGC)E 73 nt7.43□□□□□ -1.22
SMK1P41808 tA(UGC)GtA(UGC)G 73 nt7.43□□□□□ -1.22
SMK1P41808 tA(UGC)LtA(UGC)L 73 nt7.43□□□□□ -1.22
SMK1P41808 tA(UGC)OtA(UGC)O 73 nt7.43□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YLR460CYLR460C 1131 nt7.43□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YNL165WYNL165W 1221 nt7.43□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YIR035CYIR035C 765 nt7.42□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YHC3YJL059W 1227 nt7.42□□□□□ -1.22
SMK1P41808 SWM1YDR260C 513 nt7.41□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YJL009WYJL009W 327 nt7.41□□□□□ -1.22
SMK1P41808 YJR149WYJR149W 1215 nt7.41□□□□□ -1.22
SMK1P41808 FET5YFL041W 1869 nt7.41□□□□□ -1.22
SMK1P41808 STF1YDL130W-A 261 nt7.4□□□□□ -1.22
SMK1P41808 ATG17YLR423C 1254 nt7.4□□□□□ -1.22
SMK1P41808 ALR1YOL130W 2580 nt7.39□□□□□ -1.23
SMK1P41808 TRP2YER090W 1524 nt7.39□□□□□ -1.23
SMK1P41808 EMC3YKL207W 762 nt7.39□□□□□ -1.23
SMK1P41808 THI6YPL214C 1623 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 snR86snR86 1004 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 CHS7YHR142W 951 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 BUB2YMR055C 921 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 REC114YMR133W 1287 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 YMR166CYMR166C 1107 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 MET22YOL064C 1074 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 YPL108WYPL108W 507 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 FCY1YPR062W 477 nt7.38□□□□□ -1.23
SMK1P41808 CIT3YPR001W 1461 nt7.36□□□□□ -1.23
SMK1P41808 SNU71YGR013W 1863 nt7.36□□□□□ -1.23
SMK1P41808 MAM3YOL060C 2121 nt7.36□□□□□ -1.23
SMK1P41808 OLA1YBR025C 1185 nt7.36□□□□□ -1.23
SMK1P41808 YBR056WYBR056W 1506 nt7.36□□□□□ -1.23
SMK1P41808 YMR007WYMR007W 381 nt7.35□□□□□ -1.23
SMK1P41808 LSP1YPL004C 1026 nt7.35□□□□□ -1.23
SMK1P41808 MDL2YPL270W 2322 nt7.35□□□□□ -1.23
SMK1P41808 HXT11YOL156W 1704 nt7.35□□□□□ -1.23
SMK1P41808 OCH1YGL038C 1443 nt7.35□□□□□ -1.23
SMK1P41808 BIM1YER016W 1035 nt7.34□□□□□ -1.23
SMK1P41808 CAK1YFL029C 1107 nt7.34□□□□□ -1.23
SMK1P41808 RNA170RNA170 169 nt7.34□□□□□ -1.23
SMK1P41808 PDC6YGR087C 1692 nt7.33□□□□□ -1.24
SMK1P41808 MEP1YGR121C 1479 nt7.33□□□□□ -1.24
SMK1P41808 YLR072WYLR072W 2082 nt7.32□□□□□ -1.24
SMK1P41808 BNS1YGR230W 414 nt7.32□□□□□ -1.24
SMK1P41808 RCR1YBR005W 642 nt7.31□□□□□ -1.24
SMK1P41808 YOR072WYOR072W 315 nt7.31□□□□□ -1.24
SMK1P41808 AI5_BETAQ0075 1065 nt7.3□□□□□ -1.24
SMK1P41808 YIA6YIL006W 1122 nt7.3□□□□□ -1.24
SMK1P41808 RRT14YIL127C 621 nt7.3□□□□□ -1.24
SMK1P41808 GCD11YER025W 1584 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)BtD(GUC)B 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)DtD(GUC)D 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)G1tD(GUC)G1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)G2tD(GUC)G2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)I1tD(GUC)I1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)I2tD(GUC)I2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)J1tD(GUC)J1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)J2tD(GUC)J2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)J3tD(GUC)J3 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)J4tD(GUC)J4 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)KtD(GUC)K 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)L1tD(GUC)L1 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)L2tD(GUC)L2 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)MtD(GUC)M 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 tD(GUC)OtD(GUC)O 72 nt7.29□□□□□ -1.24
SMK1P41808 YJL160CYJL160C 864 nt7.28□□□□□ -1.24
SMK1P41808 YRF1-3YGR296W 5580 nt7.28□□□□□ -1.24
SMK1P41808 YRF1-6YNL339C 5580 nt7.28□□□□□ -1.24
SMK1P41808 YRF1-7YPL283C 5580 nt7.28□□□□□ -1.24
SMK1P41808 HAL5YJL165C 2568 nt7.28□□□□□ -1.24
SMK1P41808 SRM1YGL097W 1449 nt7.27□□□□□ -1.24
SMK1P41808 SHO1YER118C 1104 nt7.27□□□□□ -1.25
SMK1P41808 RHO1YPR165W 630 nt7.27□□□□□ -1.25
SMK1P41808 YMR210WYMR210W 1350 nt7.27□□□□□ -1.25
SMK1P41808 HIS3YOR202W 663 nt7.26□□□□□ -1.25
SMK1P41808 LEA1YPL213W 717 nt7.26□□□□□ -1.25
SMK1P41808 LPD1YFL018C 1500 nt7.26□□□□□ -1.25
SMK1P41808 DUR3YHL016C 2208 nt7.25□□□□□ -1.25
SMK1P41808 PET18YCR020C 648 nt7.25□□□□□ -1.25
SMK1P41808 DPH5YLR172C 903 nt7.25□□□□□ -1.25
SMK1P41808 RIB1YBL033C 1038 nt7.25□□□□□ -1.25
SMK1P41808 MIM1YOL026C 342 nt7.25□□□□□ -1.25
SMK1P41808 EHD3YDR036C 1503 nt7.25□□□□□ -1.25
SMK1P41808 EHT1YBR177C 1356 nt7.24□□□□□ -1.25
SMK1P41808 ABP1YCR088W 1779 nt7.24□□□□□ -1.25
SMK1P41808 YPT31YER031C 672 nt7.24□□□□□ -1.25
SMK1P41808 SOD2YHR008C 702 nt7.24□□□□□ -1.25
SMK1P41808 YBR226CYBR226C 411 nt7.24□□□□□ -1.25
SMK1P41808 THI73YLR004C 1572 nt7.24□□□□□ -1.25
SMK1P41808 GUT1YHL032C 2130 nt7.24□□□□□ -1.25
SMK1P41808 CDC16YKL022C 2523 nt7.24□□□□□ -1.25
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 10.6 ms